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基于重测序数据的湖羊产羔数性状全基因组关联分析
作者姓名:谢锐  朱墨  童世锋  赵福平  刘杨
作者单位:1. 南京农业大学动物科技学院;2. 农业农村部都市农业重点实验室;3. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31572357);
摘    要:旨在利用全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)挖掘与湖羊繁殖性状相关的候选基因,解析湖羊高繁殖性状的遗传基础。本研究利用206只湖羊母羊的全基因二代重测序数据(群体平均测序深度为6×),结合第一胎产羔数、第二胎产羔数及2胎平均产羔数的表型性状,基于混合线性模型,并利用质控后的1 604 526个SNP标记进行全基因组关联分析。结果:未发现影响湖羊第一胎产羔数、第二胎产羔数和2胎平均产羔数的显著SNP位点,这可能与羊的繁殖性状是一种低遗传力性状、且受微效多基因控制有关。此外表明,本研究所使用的混合线性模型被验证是可信的。

关 键 词:全基因组关联分析  产羔数  重测序  湖羊
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