| 冷应激后民猪背脂中差异lncRNA的筛选与分析 |
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| 引用本文： | 马骏杰,汪亮,刘娣,张冬杰,杨秀芹.冷应激后民猪背脂中差异lncRNA的筛选与分析[J].畜牧兽医学报,2021,52(4):932-942. |
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| 作者姓名： | 马骏杰 汪亮 刘娣 张冬杰 杨秀芹 |
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| 作者单位： | 1. 东北农业大学动物科学技术学院, 哈尔滨 150030;2. 黑龙江省农业科学院畜牧研究所, 哈尔滨 150086;3. 农业农村部种养结合重点实验室, 哈尔滨 150086 |
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| 基金项目： | 黑龙江省杰出青年基金项目（JQ2020C005） |
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| 摘 要： | 旨在分析冷应激对猪脂肪组织内lncRNA表达的影响，探讨冷应激下lncRNA与靶基因的改变对脂肪代谢及机体的影响。本研究以6头6月龄雌性民猪为试验材料，随机分为2组，一组置于正常舍内饲养，温度控制在（18±2）℃，设为对照组；另一组置于室外半敞篷舍内饲养，温度控制在（-18±5）℃，设为试验组。处理24 h后，屠宰，取背部皮下脂肪为试验材料，通过转录组测序筛选出受低温诱导的lncRNA及其靶基因，并对差异基因开展生物学功能分析，构建两者间的调控网络。结果发现，166个差异表达lncRNAs和269个基因受到冷应激诱导，其中仅有2个为已知的lncRNAs。差异基因中有多个与机体免疫相关，如干扰素刺激基因、DHX58、PTX3和OASL等，与呼吸、氧化应激和血液循环相关的基因有KCNK3、CCDC38、GAS2L2、KNDC1、LIPG和C1QL3等，与脂类代谢相关的基因有ANGPTL4、KLF11、NUPR1和HERC5，它们均发生了显著上调。而与神经系统相关的基因，如SLIT1、MAP6、TREM2和IRFN2等则发生了显著下调。差异基因参与的生物学过程主要包括防御反应、对生物刺激的反应以及病毒的反应等。通过相关系数分析发现，144个lncRNA与208个靶基因共表达，并以反式调控为主，两者间存在着复杂的调控关系，所筛选出的靶基因显著富集到真核生物的核糖体生物发生和基底细胞癌通路。据此推测，冷应激下机体的先天免疫系统、呼吸、氧化应激、血液循环和神经系统的敏感性等生理过程均受到影响，脂类代谢发生了改变。
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| 关 键 词： | 民猪 lncRNA mRNA 冷应激 调控网络 |
| 收稿时间： | 2020-08-28 |
Screening and Analysis of Differentially Expressed lncRNA in Min Pig Back Fat after Cold Stress |
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| MA Junjie,WANG Liang,LIU Di,ZHANG Dongjie,YANG Xiuqin.Screening and Analysis of Differentially Expressed lncRNA in Min Pig Back Fat after Cold Stress[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2021,52(4):932-942. |
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| Authors: | MA Junjie WANG Liang LIU Di ZHANG Dongjie YANG Xiuqin |
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| Institution: | 1. Animal Science and Technology College of Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China;2. Institute of Animal Husbandry, Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150086, China;3. Key Laboratory of Combining Farming and Animal Husbandry of Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Harbin 150086, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Min pig lncRNA mRNA cold stress regulatory network |
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