| 基于SCoT分子标记的48份杨桃种质遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 欧景莉,朱杨帆,陈豪军,周俊岸,陈燕,何江,宁琳,潘祖建,甘卫堂. 基于SCoT分子标记的48份杨桃种质遗传多样性分析[J]. 南方农业学报, 2019, 50(8): 1680-1687. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.08.05 |
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| 作者姓名： | 欧景莉 朱杨帆 陈豪军 周俊岸 陈燕 何江 宁琳 潘祖建 甘卫堂 |
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| 作者单位： | 广西农业科学院广西亚热带作物研究所,南宁,530001 |
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| 基金项目： | 农业农村部物种品种资源保护(热带作物)项目;广西科技重大专项;广西自然科学基金项目 |
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| 摘 要： | [目的]分析48份杨桃种质的遗传多样性,为杨桃种质资源的鉴定保护及开发利用提供理论依据.[方法]从60条SCoT引物中筛选出扩增条带清晰稳定、多态性丰富的引物,对从国内外收集的48份杨桃种质材料进行PCR扩增,统计分析电泳图谱,利用Popgene 1.32计算其遗传多样性参数,采用NTSYSpc 2.1计算种质间的遗传相似系数和遗传距离,利用UPGMA法进行聚类分析,并根据遗传相似系数进行主成分分析.[结果]从60条SCoT引物中筛选出的11条引物共扩增出115条条带,其中多态性条带102条,占总条带数的88.7%,每条SCoT引物扩增的总条带数(TNB)和多态性条带数(NPB)分别为10.45和9.27条,多态性比率(PPB)为70.00%~100.00%,平均为88.84%;多态性信息量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon's信息指数(I)的平均值分别为0.77、1.7758、0.4229和0.6061.48份杨桃种质间的遗传相似系数为0.4957~0.9217,平均为0.6841.聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.6618处可将48份杨桃种质划分为三大类群,第Ⅰ类群均为甜杨桃种质,第Ⅱ类群以酸杨桃种质为主,第Ⅲ类群以甜杨桃种质为主.主成分分析结果与聚类分析结果基本一致,均与杨桃的果实风味和种质来源高度相关.[结论]杨桃种质资源具有较丰富的遗传多样性,且筛选获得的SCoT引物对杨桃种质资源有较高的多态性检测率,适用于杨桃种质资源鉴别及亲缘关系分析.
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| 关 键 词： | 杨桃 遗传多样性 SCoT标记 聚类分析 主成分分析 |
Genetic relationship analysis of 48 Averrhoa carambola L. germplasms based on SCoT marker |
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| OU Jing-li,ZHU Yang-fan,CHEN Hao-jun,ZHOU Jun-an,CHEN Yan,HE Jiang,NING Lin,PAN Zu-jian,GAN Wei-tang. Genetic relationship analysis of 48 Averrhoa carambola L. germplasms based on SCoT marker[J]. Journal of Southern Agriculture, 2019, 50(8): 1680-1687. DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2019.08.05 |
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| Authors: | OU Jing-li ZHU Yang-fan CHEN Hao-jun ZHOU Jun-an CHEN Yan HE Jiang NING Lin PAN Zu-jian GAN Wei-tang |
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