| 咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析 |
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| 引用本文： | 闫林,黄丽芳,王晓阳,孙燕,林兴军,董云萍,龙宇宙.咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析[J].南方农业学报,2019,50(3):491-499. |
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| 作者姓名： | 闫林 黄丽芳 王晓阳 孙燕 林兴军 董云萍 龙宇宙 |
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| 作者单位： | 中国热带农业科学院香料饮料研究所/农业农村部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室/海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室,海南万宁,571533 |
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| 基金项目： | 海南省自然科学基金项目;中国热带农业科学院基本科研业务费专项项目;农业农村部热带作物种质资源保护项目 |
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| 摘 要： | 目的]对我国收集保存的咖啡种质资源进行遗传多样性分析,为咖啡种质资源的收集、保存、鉴定、创新及有效利用提供理论参考.方法]从哥伦比亚大学(UBC Primer Set#9)公布的100个ISSR引物序列中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复性好的引物,利用其对72份咖啡种质材料进行扩增,对电泳图谱进行统计分析,并利用NT-SYSpc 2.1计算遗传相似系数和遗传距离.根据非加权算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,并进行主坐标分析.结果]筛选出的19条引物共扩增出153条条带,其中多态性条带数为128条,占总条带数的83.7%;72份咖啡种质材料间的遗传相似系数为0.4531~0.9609,平均为0.6567;遗传距离为0.0351~1.0951,平均为0.4081.其中,大粒种种内遗传相似系数最大(0.9297~0.9531),遗传距离最小(0.0445~0.0669);中粒种种内遗传相似系数最小(0.5781~0.8750),遗传距离最大(0.1210~0.5363).主坐标分析与聚类分析结果一致,均显示72份咖啡种质材料可分为三大类,其中3份大粒种、3份查理种及1份中粒种巴布亚新几内亚-2聚为Ⅰ类群;32份小粒种聚为聚为Ⅱ类群;除巴布亚新几内亚-2外的其他31份中粒种及1份中小粒杂交种Arabusta和1份福建咖啡共33份聚为Ⅲ类群.聚类分析结果与种质地理来源无明显相关性.结论]咖啡种质资源各种间存在较大的遗传差异,以中粒种种内遗传多样性较丰富,以大粒种种内遗传多样性较低.利用ISSR分子标记可准确分析咖啡资源遗传多样性.
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| 关 键 词： | 咖啡 ISSR 遗传多样性 聚类分析 主坐标分析 |
Genetic diversity of coffee gemeplasms by ISSR analysis |
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| YAN Lin,HUANG Li-fang,WANG Xiao-yang,SUN Yan,LIN Xing-jun,DONG Yun-ping,LONG Yu-zhou.Genetic diversity of coffee gemeplasms by ISSR analysis[J].Journal of Southern Agriculture,2019,50(3):491-499. |
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| Authors: | YAN Lin HUANG Li-fang WANG Xiao-yang SUN Yan LIN Xing-jun DONG Yun-ping LONG Yu-zhou |
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