| 使用Cytoscape对生物网络数据的建模和分析 |
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| 引用本文： | 江珊,蒋勃,徐桂珍,李继红,乐毅. 使用Cytoscape对生物网络数据的建模和分析[J]. 农业网络信息, 2017, 0(6). DOI: 10.3969/j.issn.1672-6251.2017.06.009 |
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| 作者姓名： | 江珊 蒋勃 徐桂珍 李继红 乐毅 |
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| 作者单位： | 1. 安徽省农业科学院农业经济与信息研究所;安徽农业大学信息与计算机学院;2. 安徽农业大学信息与计算机学院;3. 安徽省农业科学院农业经济与信息研究所 |
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| 摘 要： | 生物网络是系统生物学研究的重要内容。本文介绍了多种常用复杂生物网络可视化系统,针对Cytoscape系统在可视化的建模过程以及在建模过程中使用到的布局算法进行对比研究,并利用Cytoscape系统中丰富的插件对复杂网络数据进行分析,包括对数据进行网络分析和更改、使用BINGO插件进行基因注释、使用AGILENT LITERATURE SEARCH(ALS)插件搜索基因相互作用文献等。
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| 关 键 词： | 复杂生物网络 Cytoscape 建模 布局算法 插件 BiNGO ALS |
Biological Network Data Modeling and Analysis by Using Cytoscape |
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| JIANG Shan,JIANG Bo,XU Guizhen,LI Jihong,LE Yi. Biological Network Data Modeling and Analysis by Using Cytoscape[J]. Agriculture Network Information, 2017, 0(6). DOI: 10.3969/j.issn.1672-6251.2017.06.009 |
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| Authors: | JIANG Shan JIANG Bo XU Guizhen LI Jihong LE Yi |
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