| 罗非鱼源无乳链球菌cpsE基因的克隆和分子特性分析 |
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| 引用本文： | 汪开毓,付希,肖丹,黄锦炉,王均,王浩丞. 罗非鱼源无乳链球菌cpsE基因的克隆和分子特性分析[J]. 水产学报, 2011, 35(5): 660-667. DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17332 |
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| 作者姓名： | 汪开毓 付希 肖丹 黄锦炉 王均 王浩丞 |
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| 作者单位： | 1. 四川农业大学鱼病研究中心,四川,雅安625014;四川农业大学动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川雅安625014
2. 通威股份有限公司,四川成都,610041 |
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| 基金项目： | 教育部《长江学者和创新团队发展计划》创新团队项目(IRT0848);通威股份有限公司重点资助项目(2006-2009) |
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| 摘 要： | 利用特异性引物,采用PCR扩增出分离自患病罗非鱼无乳链球菌强毒株的cpsE基因,将其克隆到pMD19-T载体上,通过菌落PCR鉴定和利用限制性内切酶BamHⅠ和HindⅢ对重组质粒进行双酶切鉴定之后送测序公司测序,并利用生物信息学软件Clustal X 2.0、MEGA 4.1、Bioedit 7.0、TMHMM、NetPhos 2.0、NetNGlyc 1.0、SignalP 3.0 Server、PSIpred、SAM_T08以及CUSP等分析cpsE基因的分子特性。结果显示,罗非鱼源无乳链球菌cpsE编码氨基酸序列具有高度保守性,与人源、动物源无乳链球菌亲缘性达100%,具有1个参与催化糖基元转运的Glycosyltransferases超级家族结构域,具有与蛋白翻译后修饰功能相关的磷酸化位点3个,编码多肽链中亲水区大于疏水区,且存在跨膜区。密码子偏爱性分析表明,罗非鱼源无乳链球菌cpsE基因密码子使用频率差异较大,密码子偏爱性更接近真核生物。
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| 关 键 词： | 无乳链球菌 cpsE基因 克隆 分子特性 |
| 收稿时间： | 2011-01-11 |
| 修稿时间： | 2011-03-12 |
Cloning and molecular characterization of cpsE gene of Streptococcus agalactiae isolated from tilapia |
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| WANG Kai-yu,FU Xi,XIAO Dan,HUANG Jin-lu,WANG Jun and WANG Hao-cheng. Cloning and molecular characterization of cpsE gene of Streptococcus agalactiae isolated from tilapia[J]. Journal of Fisheries of China, 2011, 35(5): 660-667. DOI: 10.3724/SP.J.1231.2011.17332 |
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| Authors: | WANG Kai-yu FU Xi XIAO Dan HUANG Jin-lu WANG Jun WANG Hao-cheng |
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| Affiliation: | Fisheries Department of Sichuau Agricultural University,Fisheries Department of Sichuau Agricultural University,Tongwei Co Ltd,Chengdu,Fisheries Department of Sichuau Agricultural University,Fisheries Department of Sichuau Agricultural University,Fisheries Department of Sichuau Agricultural University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Streptococcus agalactiae cpsE gene cloning molecular characterization |
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