| 捻转血矛线虫伊维菌素耐药相关长链非编码RNA及其调控功能分析 |
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| 引用本文： | 陈昕迪,王腾宇,刘春霞,王文龙.捻转血矛线虫伊维菌素耐药相关长链非编码RNA及其调控功能分析[J].中国农业大学学报,2023,28(1):190-202. |
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| 作者姓名： | 陈昕迪 王腾宇 刘春霞 王文龙 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学 兽医学院/农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室, 呼和浩特 010010;内蒙古农业大学 生命科学学院, 呼和浩特 010010 |
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| 基金项目： | 内蒙古自然科学基金项目(2020MS03012)；内蒙古自治区科技计划项目(201702074) |
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| 摘 要： | 为探究捻转血矛线虫伊维菌素耐药分子标记和关键调控元件，通过高质量的长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)表达谱对捻转血矛线虫敏感与耐药虫株lncRNA的顺式调控(Cis-regulation, cis)和竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA,ceRNA)调控进行分析，筛选影响虫体伊维菌素耐药机制的微小调控分子。本研究利用RNA-seq技术对捻转血矛线虫伊维菌素敏感虫株和耐药虫株进行测序，根据生物学软件预测结果，筛选出位于蛋白编码基因上下游10 kb以内的lncRNA作为顺式调控作用的元件。对差异lncRNA进行GO和KEGG富集分析，并将显著差异的lncRNA和miRNA通过Target finder和Cytoscape v3.7.1软件建立lncRNA-miRNA调控网络和可视化分析。根据miRNA调控元件对lncRNA-circRNA-miRNA-mRNA调控网络进行连通性分析，结合耐药相关信号通路的富集结果构建lncRNA-miRNA-mRNA可视化网络，同时对随机选取的10个差异lncRNA进行qRT-PCR验证。...
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| 关 键 词： | 捻转血矛线虫 伊维菌素 耐药性 长链非编码RNA 竞争性内源RNA |
| 收稿时间： | 2022/5/7 0:00:00 |
Analysis of long non-coding RNAs associated with Ivermectin resistance and its regulatory function in Haemonchus contortus |
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| CHEN Xindi,WANG Tengyu,LIU Chunxi,WANG Wenlong.Analysis of long non-coding RNAs associated with Ivermectin resistance and its regulatory function in Haemonchus contortus[J].Journal of China Agricultural University,2023,28(1):190-202. |
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| Authors: | CHEN Xindi WANG Tengyu LIU Chunxi WANG Wenlong |
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| Institution: | Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Technology in Animal Disease of Ministry of Agriculture/College of Veterinary Medicine, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010010, China;College of Life Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010010, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Haemonchus contortus Ivermectin drug resistance long non-coding RNA competing endogenous RNA |
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