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乐都紫皮大蒜4种病毒多重RT-PCR检测技术的建立
引用本文:张 超,董怡衡,岳 苗,等. 乐都紫皮大蒜4种病毒多重RT-PCR检测技术的建立[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2023, 51(1): 120-129
作者姓名:张 超  董怡衡  岳 苗  
作者单位:青海大学 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室
基金项目:青海省科技计划项目(2019-N-106)
摘    要:【目的】建立乐都紫皮大蒜4种病毒的多重RT PCR快速检测方法,为大蒜病毒病病原鉴定、脱毒效果验证等提供技术支撑。【方法】根据乐都紫皮大蒜RNA全长转录组测序结果,分别设计洋葱黄矮病毒(onion yellow dwarf virus,OYDV)、大蒜潜隐病毒(garlic latent virus,GLV)、大蒜D病毒(garlic virus D,GarVD)和大蒜X病毒(garlic virus X,GarVX)4种病毒的外壳蛋白特异性引物,筛选不同引物,优化引物用量、模板用量、退火温度等条件,并进行了多重RT PCR的灵敏度检测和12份引进栽培大蒜种质资源的病毒检测。【结果】通过优化筛选,在一个PCR反应体系中实现了OYDV(1 232 bp)、GLV(831 bp)、GarVD(506 bp)和GarVX(116 bp)4种病毒的多重检测,最优反应条件为退火温度55 ℃,模板用量2.5 μL,混合引物用量1.0 μL。多重RT PCR的灵敏度略低于单一RT-PCR。对引进的12份栽培大蒜资源进行4种病毒的多重RT-PCR检测发现,有5份资源存在4种病毒,4份资源存在2种病毒,3份资源存在1种病毒。对7份资源中经多重PCR未检测到的病毒,使用单一RT-PCR进行检测和验证发现,除1份内蒙古资源(NMG)的1种病毒(GarVX)外,多重RT PCR结果与单一RT-PCR检测结果一致。【结论】本研究建立的大蒜多重RT-PCR体系可靠性强,可用于大蒜病毒的检测与防控

关 键 词:乐都紫皮大蒜;病毒检测;多重RT-PCR;洋葱黄矮病毒;大蒜潜隐病毒;大蒜D病毒;大蒜X病毒
收稿时间:2021-12-31

Establishment of a multiplex RT-PCR system for simultaneous detection of four viruses in Ledu purple garlic
ZHANG Chao,DONG Yiheng,YUE Miao,et al. Establishment of a multiplex RT-PCR system for simultaneous detection of four viruses in Ledu purple garlic[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2023, 51(1): 120-129
Authors:ZHANG Chao  DONG Yiheng  YUE Miao  et al
Abstract:
Keywords:Ledu purple garlic  virus detection  multiplex RT-PCR  onion yellow dwarf virus  garlic latent virus  garlic virus D  garlic virus X
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