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奶牛PSME3基因CDS区克隆、表达及生物信息学分析
引用本文:任倩倩,李宇航,杨 箭,罗仍卓么,王兴平,魏大为,马 云.奶牛PSME3基因CDS区克隆、表达及生物信息学分析[J].西北农业学报,2023(2):169-178.
作者姓名:任倩倩  李宇航  杨 箭  罗仍卓么  王兴平  魏大为  马 云
作者单位:(1.宁夏大学 农学院,银川 750021;2.宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室,银川 750021)
基金项目:宁夏高等学校科学研究项目(NGY2020007);国家自然科学基金(31960652,32060749);宁夏回族自治区重点研发计划(引才专项)(2019BEB04002);宁夏大学引进人才科研启动项目(030900002151)。
摘    要:旨在探讨蛋白酶体激活亚基3(proteasome activator subunit 3,PSME3)基因的序列特征,及其在奶牛乳腺组织中的表达和功能。采用qPCR法检测PSME3基因在健康奶牛和大肠杆菌(Escherichia coli)诱导的乳腺炎奶牛的乳腺组织中的表达量;通过基因克隆与测序方法获得奶牛PSME3基因的编码区(CDS)全长序列,并利用生物信息学方法分析PSME3基因及其编码的蛋白质的结构与功能。结果表明,与健康奶牛相比,PSME3基因在E.coli诱导的乳腺炎奶牛乳腺组织中的表达显著上调;PSME3基因的CDS区全长为765 bp,编码1条由254个氨基酸组成的较稳定且无跨膜结构域的非分泌型蛋白质,含有PA28α和PA28β结构域,主要在细胞核中发挥作用。PSME3可通过核转位因子-κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路参与调节乳腺细胞的质膜合成、细胞周期、增殖凋亡以及奶牛乳腺组织的免疫反应等多种生物学过程。

关 键 词:奶牛  PSME3基因  生物信息学  基因表达  乳腺炎

Cloning,Expression and Bioinformatic Analysis of CDS Region of PSME3 Gene in Dairy Cows
REN Qianqian,LI Yuhang,YANG Jian,LUORENGZHUOMA,WANG Xingping,WEI Dawei and MA Yun.Cloning,Expression and Bioinformatic Analysis of CDS Region of PSME3 Gene in Dairy Cows[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2023(2):169-178.
Authors:REN Qianqian  LI Yuhang  YANG Jian  LUORENGZHUOMA  WANG Xingping  WEI Dawei and MA Yun
Abstract:
Keywords:Cow    PSME3  gene  Bioinformatics  Gene expression  Mastitis
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