| 绒山羊胚胎期次级毛囊发生发育相关miRNA的筛选及靶基因验证 |
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| 引用本文： | 尚方正,马荣,戎友俊,潘剑锋,王敏,牛舒冉,齐云鹏,李彦伯,李金泉,张燕军.绒山羊胚胎期次级毛囊发生发育相关miRNA的筛选及靶基因验证[J].中国农业大学学报,2023,28(2):90-103. |
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| 作者姓名： | 尚方正 马荣 戎友俊 潘剑锋 王敏 牛舒冉 齐云鹏 李彦伯 李金泉 张燕军 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学 动物科学学院/农业农村部肉羊遗传育种重点实验室/内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室/内蒙古自治区山羊遗传育种工程技术研究中心, 呼和浩特 010018 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划资助(2021YFD1200902)；内蒙古自治区科技重大专项项目(2021ZD0012)；研究生科研创新项目(B20210175Z) |
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| 摘 要： | 为筛选绒山羊次级毛囊发生发育相关microRNA(miRNA)及靶基因验证，本研究基于课题组前期高通量测序技术得到绒山羊胎儿期(45、55、65、75、95、115和135 d)皮肤组织miRNA表达谱的基础上，鉴定各比对组中差异表达的miRNA并根据毛囊形态发生规律筛选次级毛囊发生发育相关的miRNA，运用RNAhybrid、miRanda和TargetScan软件预测筛选到的miRNA靶基因并与次级毛囊发育相关基因取交集，所得基因进行GO和KEGG富集分析，筛选毛囊发生发育重要通路中的关键基因构建miRNA-mRNA调控网络，进而运用双荧光素酶报告验证关键miRNA-mRNA的靶向关系。结果表明:1)筛选到次级毛囊发生发育相关miRNA 153个，共预测到32 978个靶基因；2)取交集后得到1 352个靶向的次级毛囊发生发育相关的基因，且显著富集在29条KEGG通路中，其中毛囊发生发育重要通路TGF-β同样显著富集；3)构建了chi-miR-26b-5p-SMAD1和 chi-miR-495-3p-SMAD1等232对次级毛囊发生发育可能相关的miRNA-mRNA关系对，双荧光素酶报告系统进一步验证了关键靶向关系。本研究为解析miRNA在绒山羊次级毛囊发育过程中的分子机制奠定了前期基础。
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| 关 键 词： | 绒山羊 次级毛囊 miRNA 靶基因 |
| 收稿时间： | 2022/2/18 0:00:00 |
Screening of miRNAs related to secondary hair follicle development in cashmere goats and validation of their target genes |
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| SHANG Fangzheng,MA Rong,RONG Youjun,PAN Jianfeng,WANG Min,NIU Shuran,QI Yunpeng,LI Yanbo,LI Jinquan,ZHANG Yanjun.Screening of miRNAs related to secondary hair follicle development in cashmere goats and validation of their target genes[J].Journal of China Agricultural University,2023,28(2):90-103. |
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| Authors: | SHANG Fangzheng MA Rong RONG Youjun PAN Jianfeng WANG Min NIU Shuran QI Yunpeng LI Yanbo LI Jinquan ZHANG Yanjun |
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| Institution: | College of Animal Science/Key Laboratory of Mutton Sheep Genetics and Breeding, Ministry of Agriculture/Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction/ Engineering Research Center forGoat Genetics and Breeding, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010018, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cashmere goats secondary hair follicle miRNA target gene |
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