| 绵羊BMPR-IB基因密码子使用偏好和适应性进化分析 |
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| 引用本文： | 刘爱菊,郝永兰,李捷鑫,田树军. 绵羊BMPR-IB基因密码子使用偏好和适应性进化分析[J]. 河北农业大学学报, 2016, 0(5). DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2016.0114 |
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| 作者姓名： | 刘爱菊 郝永兰 李捷鑫 田树军 |
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| 作者单位： | 1. 河北农业大学动物科技学院,河北保定,071001;2. 河北农业大学动物科技学院,河北保定071001;河北省牛羊胚胎工程技术研究中心,河北保定071001 |
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| 基金项目： | 河北农业大学青年学术带头人培养计划，河北省科技计划项目(16826618D) |
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| 摘 要： | 探讨BMPR-IB编码特点可为提高外源基因在受体物种中稳定、高效表达提供重要依据。本研究运用CHIPS、CUPS和CodonW分析绵羊BMPR-IB基因序列,与不同物种BMPR-IB、模式生物基因组及其他多胎主效基因比较,构建进化树后,利用PAML分析BMPR-IB对环境的适应性。结果表明:绵羊BMPR-IB基因与多胎性状相关的主效基因及除人类、倭黑猩猩和家犬外的不同物种CDS序列中大部分偏好使用G/C结尾密码子,对17种密码子具有偏好性,偏好性较强的密码子为GTG(2.02);绵羊多胎性状相关的BMP-15、GDF-9主效基因,对27种密码子具有偏好性,使用频率最高的为TGT(2.79)。密码子偏好性的聚类结果类似于进化结果,且不同物种的BMPR-IB基因中性选择的作用比例较高;绵羊与3种模式生物基因组密码子使用频率比较发现,小鼠基因组优于酵母和大肠杆菌。本研究结果为今后进一步开展绵羊新基因的发现、功能基因表达调控研究等提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 绵羊 BMPR-IB 密码子偏好 适应性 |
Codon useage patterns and adaptive evolution of BMPR-IB gene in Ovis aries |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ovis aries BMPR-IB codon bias adaptability |
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