大鳍鳠IL-1β基因cDNA克隆及表达分析 |
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引用本文: | 杨莹莹,张其中,李春涛,陈霞,朱成科,李超.大鳍鳠IL-1β基因cDNA克隆及表达分析[J].水产学报,2012,36(3). |
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作者姓名: | 杨莹莹 张其中 李春涛 陈霞 朱成科 李超 |
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作者单位: | 1. 西南大学生命科学学院,淡水生物生殖与发育教育部重点实验室,三峡库区生态环境教育部重点实验室,水产科学重庆市市级重点实验室,重庆400715 2. 西南大学生命科学学院,淡水生物生殖与发育教育部重点实验室,三峡库区生态环境教育部重点实验室,水产科学重庆市市级重点实验室,重庆400715;暨南大学水生生物研究所,广东广州510632 |
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摘 要: | 白细胞介素1β(interleukin-1β,IL-1β)作为炎症反应的关键介导物,通过开启基因的表达来调控免疫反应。为了丰富鱼类该基因的研究,实验采用RT-PCR和RACE-PCR技术,首次从鲇形目鱼类大鳍鳠中获得IL-1β基因cDNA的全序列。大鳍鳠IL-1β基因cDNA全长1 194 bp,包括3'非编码区域(UTR)为224 bp,5'UTR为82 bp,开放阅读框(ORF)为888 bp,编码296个氨基酸。预测的蛋白质分子量为33.843 43 ku,等电点为5.00。与斑点叉尾等其他8种脊椎动物进行同源性分析发现,大鳍鳠IL-1β氨基酸序列与斑点叉尾相似性最高,为79.0%,与原鸡的相似性最低,为22.0%。进化树分析表明,大鳍鳠IL-1β与斑点叉尾聚为一支。半定量PCR显示,大鳍鳠IL-1β基因在肌肉、脑、脾脏、头肾、体肾、胃、皮肤、肝脏及肠等组织中都有不同程度的表达;经嗜水气单胞菌刺激后大鳍鳠IL-1β基因在头肾和脾脏的转录表达显示,1 d后该基因在头肾与脾脏中的表达量都达到最大,15 d后恢复到刺激前的水平。研究显示,大鳍鳠IL-1β在抵御病原感染过程中发挥重要作用。
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关 键 词: | 大鳍鳠 白细胞介素1β 基因 克隆 组织分布 |
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