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牡丹Ty3-gypsy 类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析
引用本文:侯小改,郭大龙,黄燕梅,张曦. 牡丹Ty3-gypsy 类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析[J]. 园艺学报, 2013, 40(1): 98-106
作者姓名:侯小改  郭大龙  黄燕梅  张曦
作者单位:(1 河南科技大学农学院,河南洛阳 471003;2 河南科技大学林学院,河南洛阳 471003)
基金项目:国家自然科学基金项目(31070620);河南省高校科技创新人才支持计划项目(2010HASTTT002);河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(2010GGJS-072)
摘    要: 根据Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并引物,从中原牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews)品种‘洛阳红’和野生种卵叶牡丹(Paeonia qiui Y. L. Pei et D. Y. Hong)中扩增出430 bp左右的目标片段。目的条带经回收、克隆、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了13条来自牡丹的Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶序列。这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为缺失突变,序列长度变化范围为412 ~ 446 bp,同源性范围为71.5% ~ 94.8%。翻译成氨基酸后,有12条序列出现1 ~ 9个不同程度的终止密码子突变,3条序列出现移框突变。其核苷酸序列经过系统聚类后可分为6个家族。将其氨基酸序列与已登录的不同物种Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的氨基酸序列进行聚类分析,结果表明与其他植物具有较高的同源性,表明它们间可能存在着Ty3-gypsy反转录转座子的横向传递。

关 键 词:牡丹  Ty3-gypsy 类反转录转座子  反转录酶  异质性

Cloning and Analysis of Reverse Trancriptase of Ty3-gypsy-like Retrotransposons in Tree Peony(Paeonia)
HOU Xiao-gai,GUO Da-long,HUANG Yan-mei,and ZHANG Xi. Cloning and Analysis of Reverse Trancriptase of Ty3-gypsy-like Retrotransposons in Tree Peony(Paeonia)[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2013, 40(1): 98-106
Authors:HOU Xiao-gai  GUO Da-long  HUANG Yan-mei  and ZHANG Xi
Affiliation:(1College of Agriculture,Henan University of Science & Technology,Luoyang,Henan 471003,China;2College of Forestry,Henan University of Science & Technology,Luoyang,Henan 471003,China)
Abstract:
Keywords:
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