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铁氧化菌菌株EEELCW01的基因组分析及砷转化功能
作者姓名:熊潇然  邹奇  吴川  夏礼兵  潘炜松
作者单位:1.湖南农业大学生物科学技术学院,湖南 长沙 410128;2.华南师范大学生命科学学院,广东 广州 510006;3.中南大学冶金与环境学院,湖南 长沙 410083
基金项目:国家自然科学基金项目(42177392)
摘    要:以从砷污染农田土壤中分离的1株铁氧化细菌EEELCW01为研究对象,对该菌进行全基因组分析,通过GO、KEGG、COG等数据库比对,预测该菌砷相关基因的功能;采用水培试验,验证该菌的砷转化能力。结果表明:菌株EEELCW01基因组大小为4 714 242 bp,具有2条大小分别为2 065 078 bp和2 649 164 bp的染色体,GC含量为55.99%,染色体上有4588个CDS,包含58个tRNA和12个rRNA;COG数据库注释表明该菌基因功能主要集中在氨基酸转运代谢、无机离子转运代谢等过程,GO数据库注释表明该菌主要包含膜组成部分、氧化还原过程和相关酶活性等功能,KEGG注释显示代谢相关的基因占比最高;菌株EEELCW01基因组中含有多种与砷代谢相关的基因(arsC、arsH、arsB、arsR、acr3、arrA、arxA和arsM);菌株EEELCW01将As(Ⅴ)还原为As(Ⅲ)的能力强,有氧条件下,3 d时还原率达40.1%。可见,可利用该菌株促进砷的生物还原,并联合砷超富集植物进行环境砷污染修复。

关 键 词:砷;铁氧化菌;砷转化;基因组分析;功能注释
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