从江香猪CYP2A19基因单核苷酸多态性的群体遗传学分析 |
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引用本文: | 杨家大,任琼,吴声榕.从江香猪CYP2A19基因单核苷酸多态性的群体遗传学分析[J].南方农业学报,2016(7):1209-1215. |
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作者姓名: | 杨家大 任琼 吴声榕 |
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作者单位: | 1. 凯里学院环境与生命科学学院,贵州凯里,556011;2. 贵州省从江县农业局,贵州从江,557400;3. 凯里学院图书馆,贵州凯里,556011 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(81460572) |
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摘 要: | 【目的】评估从江香猪CYP2A19基因的纯合度及遗传变异,为开发从江香猪药物代谢模型积累基础资料。【方法】应用SNa Pshot检测方法对141份从江香猪样本CYP2A19基因编码区rs323914689、rs81217981、rs333289891、rs343272409位点及3'端非翻译区rs338584662和rs321736682位点进行分型分析,并计算从江香猪种群的基因型频率、等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、杂合度(He)、多态位点数及多态位点百分比。【结果】除rs333289891位点表现为单态外,其余5个位点均检测到2种或3种基因型,多态位点百分比为83.33%。χ2检验结果显示,5个多态位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P0.05)。5个多态位点的Ne介于1.0071~1.3129,He介于0.0071~0.2057。【结论】不同品系猪种由于遗传背景差异而具有不同的单核苷酸变异,其药物代谢特性也因此存在差异。从江香猪群体纯合度高、遗传稳定性好、变异程度低,是其作为药物代谢动物模型的关键基础。
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关 键 词: | 从江香猪 CYP2A19基因 多态位点 遗传学分析 |
Population genetics of single nucleotide polymorphisms of CYP2A19 gene in Congjiang Xiang-pig |
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Abstract: | |
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Keywords: | Congjiang Xiang-pig CYP2A 19 gene polymorphic loci genetic analysis |
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