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| 利用EST-SSR分析江北茶区茶树资源的遗传多样性和遗传结构 | |
| 引用本文： | 姚明哲,刘振,陈亮,王新超,马春雷,梁月荣.利用EST-SSR分析江北茶区茶树资源的遗传多样性和遗传结构[J].茶叶科学,2009,29(3). |
| 作者姓名： | 姚明哲 刘振 陈亮 王新超 马春雷 梁月荣 |
| 作者单位： | 1. 浙江大学农业与生物技术学院,浙江,杭州310029;中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心,浙江,杭州310008 2. 中国农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心,浙江,杭州310008 3. 浙江大学农业与生物技术学院,浙江,杭州310029 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)，浙江省钱江人才计划，浙江省自然科学基金 |
| 摘 要： | 利用25对EST-SSR引物对江北茶区的45份茶树初级核心种质的遗传多样性、遗传结构和亲缘关系进行了分析。25对引物共检测到83个等位位点,平均每对引物可检测到等位位点3.3个,可鉴定的基因型为6个。引物的PIC值平均为0.61,扩增位点的观测杂合度高于期望杂合度。45份供试种质中可观测的等位位点平均为4.2个,有效等位位点为2.8个。等位位点观测杂合度平均为0.73,基因多样性指数为0.61,Shannon信息指数为1.11。江北茶区主要省份间茶树种质的遗传分化程度较低(Gst=0.2),而基因流(Nm=3.9)较高。AMOVA分析显示,95.97%的变异发生于居群内。45份供试种质间的遗传相似系数在0.32~0.89之间,聚类分析表明供试资源在亲缘关系上未表现出明显的地区分化。湖北、安徽和陕西三个主要省份茶树种质间的遗传距离平均为0.048,其中陕西资源在亲缘关系上略远于湖北和安徽。 |
| 关 键 词： | 茶树 EST-SSR 遗传多样性 遗传结构 |
Genetic Diversity and Structure of Tea Germplasm Originated from Region of North Yangtze River Based on EST-SSR Markers |
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| YAO Ming-zhe,LIU Zhen,CHEN Liang,WANG Xin-chao,MA Chun-lei,LIANG Yue-rong.Genetic Diversity and Structure of Tea Germplasm Originated from Region of North Yangtze River Based on EST-SSR Markers[J].Journal of Tea Science,2009,29(3). | |
| Authors: | YAO Ming-zhe LIU Zhen CHEN Liang WANG Xin-chao MA Chun-lei LIANG Yue-rong |
| Institution: | 1.College of Agriculture and Biological Technology;Zhejiang University;Hangzhou 310029;China;2.National Center for Tea Improvement;Tea Research Institute Chinese Academy of Agricultural Sciences;Hangzhou 310008;China |
| Abstract: | The 25 pairs of EST-SSR primers were used to analyze the genetic diversity,genetic structure and genetic relationship of 45 tea accessions originated from region of north Yangtze River.Totally 83 alleles were identified,on an average of 3.3 alleles each pair of primers.The mean of polymorphism information content(PIC) was 0.61.The observed heterozygosity(Ho) was averagely higher than the expected heterozygosity(He).Among 45 tea accessions the average numbers of the observed alleles were 4.2,and the number o... |
| Keywords: | EST-SSR |
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