| 棉花CML基因家族成员鉴定与功能分析 |
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| 引用本文： | 杨秀,许艳超,杨芳芳,蔡小彦,侯宇清,王玉红,王星星,王坤波,刘方,周忠丽.棉花CML基因家族成员鉴定与功能分析[J].棉花学报,2019(4):307-318. |
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| 作者姓名： | 杨秀 许艳超 杨芳芳 蔡小彦 侯宇清 王玉红 王星星 王坤波 刘方 周忠丽 |
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| 作者单位： | 棉花生物学国家重点实验室/中国农业科学院棉花研究所 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2016YFD0100203,2017YFD0101601) |
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| 摘 要： | 【目的】类钙调素(Calmodulin-like,CML)蛋白是1种重要的Ca2+传感器,在调节植物应激反应机制中起重要作用。对CML基因家族进行全基因组学分析,以便深入研究CML基因在棉花逆境胁迫下的作用。【方法】利用生物信息学的方法进行了棉花CML家族成员的鉴定。利用转录组数据和反转录聚合酶链式反应分析陆地棉(Gossypium hirsutum L.)CML基因在盐胁迫下的表达模式。利用病毒诱导基因沉默技术对GhCML44-2基因进行沉默并进行功能验证。【结果】在陆地棉(Gossypium hirsutum L.)、雷蒙德氏棉(G. raimondii Ulbrich)、亚洲棉(G. arboreum L.)中分别获得了154个、74个、78个CML蛋白。进化树和保守基序分析表明,GhCML蛋白分为8个亚类,都含有保守的EF-hand结构域;在盐胁迫下,107个GhCML基因在叶和根中有显著的差异表达,且在根和叶中的差异表达模式不同。启动子分析表明,这些基因启动子中存在多种不同的胁迫响应元件;利用病毒诱导基因沉默技术成功沉默GhCML44-2的棉株相较于对照更加不耐盐。【结论】该研究结果有助于了解棉花CML基因家族的进化与功能,为后续研究其功能提供了一定的理论依据。
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| 关 键 词： | 棉花 类钙调素蛋白 盐胁迫 病毒诱导基因沉默 基因功能 |
Identification and Functional Analysis of CML Gene Family in Cotton |
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| Xiu,Xu Yanchao,Yang Fangfang,Cai Xiaoyan,Hou Yuqing,Wang Yuhong,Wang Xingxing,Wang Kunbo,Liu Fang,Zhou Zhongli.Identification and Functional Analysis of CML Gene Family in Cotton[J].Cotton Science,2019(4):307-318. |
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| Authors: | Xiu Xu Yanchao Yang Fangfang Cai Xiaoyan Hou Yuqing Wang Yuhong Wang Xingxing Wang Kunbo Liu Fang Zhou Zhongli |
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| Institution: | (State Key Laboratory of Cotton Biology/Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences,Anyang,Henan 455000,China) |
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| Abstract: | Xiu;Xu Yanchao;Yang Fangfang;Cai Xiaoyan;Hou Yuqing;Wang Yuhong;Wang Xingxing;Wang Kunbo;Liu Fang;Zhou Zhongli(State Key Laboratory of Cotton Biology/Institute of Cotton Research of Chinese Academy of Agricultural Sciences,Anyang,Henan 455000,China) |
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| Keywords: | cotton calmodulin-like protein salt stress virus-induced gene silencing (VIGS) gene function |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
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