| 利用BSA-seq发掘棉花适宜机采的果枝长度相关QTL |
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| 引用本文： | 徐剑文,刘剑光,赵君,王希睿,肖松华.利用BSA-seq发掘棉花适宜机采的果枝长度相关QTL[J].棉花学报,2019(4):319-326. |
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| 作者姓名： | 徐剑文 刘剑光 赵君 王希睿 肖松华 |
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| 作者单位： | 江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江中下游棉花和油菜重点实验室;南京市标准化研究院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31701475);江苏省自然科学基金(BK20170597);江苏省农业科学院探索性颠覆性创新计划(ZX(17)2013);“十三五”国家重点研发计划(2016YFD0100203-5);江苏省农科院基金(012066111622) |
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| 摘 要： | 【目的】将群体分离分析法与下一代测序技术相结合,定位与棉花果枝长度关联的数量性状位点。【方法】以Ⅰ式果枝品系苏机棉125和Ⅱ式果枝品种泗抗1号为亲本,构建棉花F2分离群体。根据F2群体单株中部果枝节间平均长度,选择极端性状单株分为2组,构建DNA混池。再对2个混池进行重测序,分析2个混池之间的单核苷酸多态性和插入缺失突变,并利用欧式距离法关联与果枝节间长度相关的数量性状位点。【结果】利用测序获得的单核苷酸多态性位点数据,在A3染色体上定位到1个与果枝节间长度关联的区域,区间范围为0.8Mbp;利用测序获得的缺失突变位点数据,也在A3染色体上定位到1个关联区域,区间范围为1.09Mbp;2个关联区域互相重合,重合区间为0.77Mbp。【结论】本研究中Ⅰ式果枝相关基因被定位在A3染色体上,说明棉花Ⅰ式果枝和〇式果枝的差异是因为遗传位点和模式的不同,而不是同一基因的剂量效应。
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| 关 键 词： | 棉花 株型育种 果枝长度 机采棉 QTL |
The Identification of QTL Associated with Cotton Fruit Branch Length Suitable for Mechanized Harvest Utilizing BSA-seq |
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| Xu Jianwen,Liu Jianguang,Zhao Jun,Wang Xirui,Xiao Songhua.The Identification of QTL Associated with Cotton Fruit Branch Length Suitable for Mechanized Harvest Utilizing BSA-seq[J].Cotton Science,2019(4):319-326. |
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| Authors: | Xu Jianwen Liu Jianguang Zhao Jun Wang Xirui Xiao Songhua |
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| Institution: | (Institute of Industrial Crops,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Cotton and Rapeseed,Ministry of Agriculture,Nanjing 210014,China;Nanjing Institute of Standardization,Nanjing 210019,China) |
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| Abstract: | Xu Jianwen;Liu Jianguang;Zhao Jun;Wang Xirui;Xiao Songhua(Institute of Industrial Crops,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Cotton and Rapeseed,Ministry of Agriculture,Nanjing 210014,China;Nanjing Institute of Standardization,Nanjing 210019,China) |
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| Keywords: | cotton plant type breeding fruit branch length machine-harvested cotton QTL |
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