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茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析
引用本文:张玥,胡雲飞,王树茂,柯子星,林金科. 茶树儿茶素合成相关MYB转录因子生物信息学分析[J]. 茶叶科学, 2018, 38(2): 162-173. DOI: 10.13305/j.cnki.jts.2018.02.007
作者姓名:张玥  胡雲飞  王树茂  柯子星  林金科
作者单位:福建农林大学安溪茶学院,福建 福州 350002
基金项目:福建省教育厅中青年教师教育科研项目,福建农林大学人才引进科研启动基金,国家自然科学基金
摘    要:从茶树(Camellia sinensis)转录组数据库中获得6个与儿茶素合成相关的MYB转录因子,对其进行蛋白理化性质与结构功能预测、核定位信号和蛋白保守结构域分析,通过同源分析构建系统发育树。结果表明,与儿茶素合成相关的6个MYB蛋白都属于亲水性的非分泌蛋白,定位在叶绿体、线粒体和细胞核上,其空间结构主要是α-螺旋和β-转角;保守结构域的分析发现除了comp159173_c0基因,其余5个都属于SANT超家族基因成员。系统进化树显示6个MYB蛋白形成4个分支,显示出各自间较远的亲缘关系。差异表达分析的结果进一步证实了6个MYB转录因子与儿茶素合成代谢的相关性。

关 键 词:儿茶素  MYB转录因子  生物信息学  
收稿时间:2017-10-12

Bioinformatic Analysis of MYB Transcription Factors Involved in Catechins Biosynthesis in Tea Plant (Camellia sinensis)
ZHANG Yue,HU Yunfei,WANG Shumao,KE Zixing,LIN Jinke. Bioinformatic Analysis of MYB Transcription Factors Involved in Catechins Biosynthesis in Tea Plant (Camellia sinensis)[J]. Journal of Tea Science, 2018, 38(2): 162-173. DOI: 10.13305/j.cnki.jts.2018.02.007
Authors:ZHANG Yue  HU Yunfei  WANG Shumao  KE Zixing  LIN Jinke
Affiliation:Anxi College of Tea Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China
Abstract:
Keywords:
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