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基于SSR标记的白化和黄化茶树品种遗传多样性分析及指纹图谱构建
引用本文:王松琳,马春雷,黄丹娟,马建强,金基强,姚明哲,陈亮.基于SSR标记的白化和黄化茶树品种遗传多样性分析及指纹图谱构建[J].茶叶科学,2018,38(1):58-68.
作者姓名:王松琳  马春雷  黄丹娟  马建强  金基强  姚明哲  陈亮
作者单位:1. 中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心/农业部茶树生物学与资源利用重点实验室,浙江 杭州 310008; 2. 中国农业科学院研究生院,北京 100081
基金项目:中国农业科学院科技创新工程,国家茶叶产业技术体系,国家自然科学基金,浙江省公益技术研究农业项目,浙江省农业(茶树)新品种选育重大科技专项子课题
摘    要:利用62对SSR引物对16个白化、黄化茶树品种资源的遗传多样性进行了分析,初步明确了不同白化、黄化品种的遗传结构,以及SSR标记在白化、黄化品种鉴定上的适用性,为此类茶树品种资源的鉴定评价提供了理论依据。经过对引物筛选和扩增条带的分析,结果显示:具有多态性的55对引物中,共检测出169个等位基因,每对引物检测出的等位基因数为2~5个,平均为3.07个;多态信息含量(PIC)和Shannon信息指数(I)的平均值分别是0.40和0.79;169个等位基因出现频率在3.12%~96.88%之间;16个参试品种的遗传距离在0.086~0.532,品种间遗传结构差异明显;当D≈0.18时,可将16个品种划分为3类,其中大部分亲缘关系相近或地理位置一致的品种聚为一类。此外,笔者根据不同引物的等位基因带型构建了16个白化和黄化茶树品种的分子指纹图谱,并筛选出3对核心引物(TM156、TM508、MSG0380)用于不同白化、黄化茶树品种的鉴定。

关 键 词:白化  黄化茶树  SSR标记  指纹图谱  
收稿时间:2017-07-07

Analysis of Genetic Diversity and Construction of DNA Fingerprints of Chlorophyll-deficient Tea Cultivars by SSR Markers
WANG Songlin,MA Chunlei,HUANG Danjuan,MA Jianqiang,JIN Jiqiang,YAO Mingzhe,CHEN Liang.Analysis of Genetic Diversity and Construction of DNA Fingerprints of Chlorophyll-deficient Tea Cultivars by SSR Markers[J].Journal of Tea Science,2018,38(1):58-68.
Authors:WANG Songlin  MA Chunlei  HUANG Danjuan  MA Jianqiang  JIN Jiqiang  YAO Mingzhe  CHEN Liang
Institution:1. Tea Research Institute of the Chinese Academy of Agricultural Sciences, National Center for Tea Improvement, Key Laboratory of Tea Biology and Resource Utilization, Ministry of Agriculture, Hangzhou 310008, China; 2. Graduate School of Chinese Academy of Agriculture Science, Beijing 100081, China
Abstract:To differentiate and identify different albino tea cultivars, sixty two SSR primers were used to analyze the genetic diversity of 16 tea cultivars that exhibit the chlorina phenotype. The result showed that a total of 169 alleles were amplified by 55 SSR primers with good polymorphism, and the number of alleles per primer ranged from 2 to 5, with an average of 3.07. The average value of polymorphism information content (PIC) and Shannon's information
Keywords:albino tea cultivars  SSR marker  fingerprinting  
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