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茶树PPO基因家族的鉴定与分析
引用本文:曾泽媛,罗勇,郑楚楚,李娟,李勤,林海燕,王坤波.茶树PPO基因家族的鉴定与分析[J].茶叶科学,2018,38(4):385-395.
作者姓名:曾泽媛  罗勇  郑楚楚  李娟  李勤  林海燕  王坤波
作者单位:1. 湖南农业大学茶学教育部重点实验室,湖南 长沙 410128; 2. 国家植物功能成分利用工程技术研究中心,湖南 长沙 410128; 3. 湖南省植物功能成分利用协同创新中心,湖南 长沙 410128
基金项目:国家自然科学基金(31670691;31500567),湖南省教育厅科研项目(15B116)
摘    要:多酚氧化酶(Polyphenol oxidases,PPO)是由核酸编码的一种以氧为受体的含铜金属酶,为一种末端氧化酶,在茶叶加工中也发挥重要的作用。从最新发布的茶树基因组数据库中获得了5条PPO基因:CsPPO1CsPPO2CsPPO3CsPPO4(GenBank登录号为GQ129142.1)、CsPPO5。本研究利用生物信息学方法,对5条基因的核酸序列和氨基酸序列进行分析,并对基因编码蛋白的理化性质和结构功能进行预测。结果表明,5个基因CDS区全长在597~1β839βbp之间,编码氨基酸数目198~612;系统进化树分析显示CsPPO1CsPPO3CsPPO4CsPPO5具有较近的亲缘关系;编码的蛋白均属于亲水性不稳定类脂类结合蛋白,都不具有信号肽;无规则卷曲是蛋白质的主要结构元件,α-螺旋和β-折叠分散于整个多肽链中,CsPPO1CsPPO2CsPPO3可能存在一个或多个跨膜螺旋;5个蛋白均含有PPO1_DWL(pfam12142)保守结构域,除了CsPPO2外,其余4个蛋白均预测到TYROSINASE功能结构域。实时定量PCR结果表明,PPOs基因在不同茶树品种间呈现出不同的表达模式。

关 键 词:茶树  多酚氧化酶  基因家族  序列分析  
收稿时间:2018-01-26

The Identification and Analysis of Polyphenol Oxidase Gene Family in Tea Plant (Camellia sinensis)
ZENG Zeyuan,LUO Yong,ZHENG Chuchu,LI Juan,LI Qin,LIN Haiyan,WANG Kunbo.The Identification and Analysis of Polyphenol Oxidase Gene Family in Tea Plant (Camellia sinensis)[J].Journal of Tea Science,2018,38(4):385-395.
Authors:ZENG Zeyuan  LUO Yong  ZHENG Chuchu  LI Juan  LI Qin  LIN Haiyan  WANG Kunbo
Institution:1. Key Laboratory of Ministry of Education for Tea Science, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China; 2. National Research Center of Engineering Technology for Utilization of Botanical Functional Ingredients, Changsha 410128, China; 3. Collaborative Innovation Center of Utilization of Functional Ingredients from Botanicals, Changsha 410128, China
Abstract:
Keywords:tea plant  polyphenol oxidase  gene family  sequence analysis  
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