| 急性盐度胁迫对日本黄姑鱼肌肉组织转录组的影响 |
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| 引用本文： | 孟玮,徐开达,李振华,史会来,周永东. 急性盐度胁迫对日本黄姑鱼肌肉组织转录组的影响[J]. 水产学报, 2021, 45(5): 649-660 |
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| 作者姓名： | 孟玮 徐开达 李振华 史会来 周永东 |
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| 作者单位： | 浙江省海洋水产研究所,浙江省海洋渔业资源可持续利用技术研究重点实验室,农业农村部重点渔场渔业资源科学观测实验站,浙江舟山 316021 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划(2017YFA0604904，2019YFD0901204)；浙江省科技计划(2019C02056) |
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| 摘 要： | 盐度是影响鱼类各种生理活动的重要环境因素,为探讨急性盐度胁迫对经济海水鱼类日本黄姑鱼基因表达水平的影响,实验基于Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台,对不同盐度条件下日本黄姑鱼幼鱼肌肉组织进行转录组测序并开展生物信息学分析。结果显示,高盐组、低盐组和对照组分别获得46 379 598、36 130 844和38 715 820条Clean reads,总碱基数分别为5.27、4.87和5.53 GB。经组装得到91 667条转录本,去冗余后拼接得到61 601条Unigenes。与对照组相比,高盐组和低盐组分别有2 230和1 377个差异Unigene上调,1 959和2 447个差异Unigene下调,随机选取6条差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证,结果与转录组测序一致。通过对显著差异表达基因进行筛选,在高盐组和低盐组中分别发现21和41个差异表达基因与离子通道相关,共有的离子通道相关基因为15个,其中14个基因表达趋势一致。而在高盐组和低盐组发现的离子转运体基因分别为6和10个。GO功能富集分析发现,差异基因显著富集在蛋白酶体、补体激...
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| 关 键 词： | 日本黄姑鱼 急性盐度胁迫 肌肉 转录组测序 离子通道 离子转运体 |
| 收稿时间： | 2020-06-30 |
| 修稿时间： | 2020-09-11 |
Transcriptome analysis of Nibea japonica under acute salinity stress |
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| MENG Wei,XU Kaid,LI Zhenhu,SHI Huilai,ZHOU Yongdong. Transcriptome analysis of Nibea japonica under acute salinity stress[J]. Journal of Fisheries of China, 2021, 45(5): 649-660 |
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| Authors: | MENG Wei XU Kaid LI Zhenhu SHI Huilai ZHOU Yongdong |
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| Affiliation: | Marine Fishery Research Institute of Zhejiang Province,,,,Marine Fishery Research Institute of Zhejiang Province |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Nibea japonica acute salinity stress muscle RNA-seq ion channel ion transporter |
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