龙头鱼ISSR-PCR多态性引物最佳退火温度的筛选 |
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引用本文: | 林彦均,杨天燕,朱岚倩,郑亦佳,王莹莹,斯舒谨,郭泽豪.龙头鱼ISSR-PCR多态性引物最佳退火温度的筛选[J].江苏农业科学,2020,48(8):70-73. |
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作者姓名: | 林彦均 杨天燕 朱岚倩 郑亦佳 王莹莹 斯舒谨 郭泽豪 |
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作者单位: | 浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022;浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022;浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022;浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022;浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022;浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022;浙江海洋大学水产学院,浙江舟山316022 |
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基金项目: | 2018年国家级大学生创新创业训练计划;浙江省大学生科技创新活动计划暨新苗人才计划;浙江海洋大学人才引进科研基金(2016-2017);浙江省一流学科(A类)大学生创新性科研项目 |
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摘 要: | 为了开展龙头鱼遗传多样性和近缘物种间的遗传变异分析,建立龙头鱼的简单序列重复区间标记(inter-simple sequence repeat,简称ISSR)-PCR反应体系,拟筛选龙头鱼ISSR-PCR多态性引物的最佳退火温度。参考加拿大哥伦比亚大学(UBC)公布的100条ISSR引物,采用温度梯度PCR的方法,得到适用于龙头鱼基因组DNA扩增的12条ISSR分子标记引物,分别为811、834、836、840、841、842、844、853、873、880、881、899。12条引物中,最高退火温度为58.9℃,最低退火温度为47℃,两者间的差异达到了11.9℃。12条引物的变异系数为7.71%,相关系数为0.23。结果表明,龙头鱼ISSR多态性引物的最佳退火温度与理论退火温度间没有显著相关性,同一种引物的退火温度在不同物种中也存在一定的差异,需要通过温度梯度试验进行具体分析。
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关 键 词: | 龙头鱼 ISSR-PCR 退火温度 引物筛选 |
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