类乌齐牦牛SIRT3基因克隆与生物信息学及差异表达分析 |
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引用本文: | 杨玉梅,柴志欣,王会,王吉坤,信金伟,姬秋梅,钟金城.类乌齐牦牛SIRT3基因克隆与生物信息学及差异表达分析[J].中国畜牧杂志,2019(6):56-62. |
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作者姓名: | 杨玉梅 柴志欣 王会 王吉坤 信金伟 姬秋梅 钟金城 |
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作者单位: | 1.西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室;2.西藏自治区农牧科学院省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室 |
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基金项目: | 西南民族大学硕士研究生创新课题重点项目(CX2018SZ117);国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37) |
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摘 要: | 本实验旨在丰富牦牛 SIRT3基因的基础研究,通过对西藏类乌齐牦牛 SIRT3基因克隆、生物信息学分析及差异表达分析,进一步探讨 SIRT3基因的生理功能及分子机制。结果表明:类乌齐牦牛 SIRT3基因CDS区长 1 002 bp,编码 333个氨基酸,与普通牛 SIRT3基因 CDS区比对存在碱基突变,编码氨基酸发生错义和同义突变,同义突变发生在碱基第 49、279、342、384 位,错义突变发生在碱基第 149 和 620 位,其编码蛋白属亲水性蛋白,有多个跨膜区域和磷酸化位点,无信号肽片段,主要位于线粒体,二级结构以无规卷曲和α-螺旋为主;SIRT3基因编码蛋白在催化活性、核苷酸结合及辅因子结合等过程发挥主要功能,主要参与生物体代谢过程;类乌齐牦牛 SIRT3基因序列与普通牛一致性较高,亲缘关系最近;QPCR分析显示,SIRT3基因在牦牛肝脏中的表达水平极显著高于其他组织(P<0.01)。
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关 键 词: | 类乌齐牦牛 SIRT3基因 克隆 生物信息学分析 组织表达 |
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