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绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析
作者姓名:宋旭婷  翟羽飞  张嘉楠  亓美玉  王志鹏  付晶  姚玉昌
作者单位:1.黑龙江普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室;2.东北农业大学动物科学技术学院;3.黑龙江省农业科学院畜牧研究所
基金项目:黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12511034)
摘    要:为明确绵羊IGF-Ⅰ基因变异剪接体的生物学特性及其在生长发育过程中的功能,本研究成功获得了IGF-Ⅰ基因Ⅱ类的2种变异剪接体(Ea和Eb型),利用生物信息学方法预测分析2种变异剪接体的结构特性,并探讨其在不同组织中的表达规律。结果表明:Ea和Eb型由同一基因通过选择性剪切形成,均是绵羊中新发现的类型,预测其分别编码138 aa和172 aa,2种变异剪接体的信号肽剪切位点、进化同源性、亚细胞定位、蛋白质空间结构预测结果类似,但二者包含不同的共价修饰位点。组织表达分析表明,2种变异剪接体在肝组织中表达量均最高,其次为脂肪、胃、睾丸、肌肉和皮肤组织,心、脾、肺、肾、肠、膀胱组织的表达水平较低;在胃中,羔羊期2种变异剪接体表达水平均极显著高于成羊期(P<0.01),在睾丸中,羔羊期IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型表达水平显著高于成羊期(P<0.05)。总体上来看,在各种组织中IGF-Ⅰ基因Ⅱ类Ea型的表达水平高于Eb型,为优势转录本类型。

关 键 词:绵羊  IGF-I基因  变异剪接体  生物信息学分析  组织表达
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