辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析 |
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引用本文: | 张烨达,王星,王丽萍,佟静,武占会,高彦魁.辣椒WOX转录因子家族的鉴定、进化与表达分析[J].河南农业科学,2023(5):130-141. |
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作者姓名: | 张烨达 王星 王丽萍 佟静 武占会 高彦魁 |
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作者单位: | 1. 河北工程大学园林与生态工程学院;2. 北京市农林科学院蔬菜研究所;3. 农业农村部都市农业(北方)重点实验室 |
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基金项目: | 河北省自然科学基金资助项目(C2021402014,C2019402430);;国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-24-B-02); |
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摘 要: | WUSCHEL(WUS)相关的同源异型盒(WOX)转录因子家族是一类植物特异性转录因子,维系植物干细胞动态平衡、茎尖分生组织形成、胚胎发育等重要生命活动。利用生物信息学方法,在遵辣1号辣椒中鉴定到10个WOX基因,命名为CaWUS—CaWOX13。CaWOXs不均等地分布在5条染色体上,被分为3个支系,亚细胞预测全部定位在细胞核上。不同支系间基因数目差异较大,同一支系的成员具有相似的基因结构和保守基序。CaWOX家族启动子包含14种有关植物生长发育、激素调控和逆境胁迫的作用元件,分布最广的为茉莉酸甲酯应答元件(MeJA responsiveness)。CaWOX家族内没有发现串联重复和大片段复制,但和拟南芥、番茄存在共线性关系。CaWUS作为关键蛋白,在蛋白质互作网络中承担枢纽作用。CaWOXs的基因表达量具有显著的差异性,部分基因在根、茎以及果实发育过程中具有重要的调控作用。
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关 键 词: | 辣椒 WOX家族 转录因子 系统进化 基因表达 共线性分析 蛋白质互作 生物信息学 |
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