| 高粱KNOX基因家族鉴定及SbKNOX22基因表达分析 |
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| 引用本文： | 陈俊,方远鹏,蒋君梅,杨再福,任明见,李向阳,蒋选利,谢鑫. 高粱KNOX基因家族鉴定及SbKNOX22基因表达分析[J]. 核农学报, 2020, 34(11): 2377-2385. DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2020.11.2377 |
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| 作者姓名： | 陈俊 方远鹏 蒋君梅 杨再福 任明见 李向阳 蒋选利 谢鑫 |
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| 作者单位： | 1贵州大学农学院,贵州 贵阳 550025; 2国家小麦改良中心贵州分中心,贵州 贵阳 550025; 3贵州大学绿色农药与农业生物工程教育部重点实验室,贵州 贵阳 550025 |
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| 基金项目： | 贵州大学引进人才科研项目;国家自然科学基金;贵州省高层次留学人才创新创业择优资助项目;贵州省科技计划 |
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| 摘 要： | KNOX基因家族是植物生长发育过程中所特有的一类转录因子,其在植物的形态建成方面发挥着重要的作用。为研究高粱KNOX基因家族特征及SbKNOX22的表达特性,本研究利用生物信息学和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的分析方法,对高粱KNOX基因家族进行了鉴定和表达分析。结果表明,在高粱中共鉴定到23个KNOX基因(SbKNOX1~SbKNOX23),亚细胞定位显示均定位于细胞核中,氨基酸序列长度介于184~802 aa之间,分子量大小介于20.23~86.14 kDa之间,理论等电点介于7.28~4.76之间,高粱KNOX基因家族蛋白均属亲水性蛋白,分布在8条染色体上。系统进化结果显示,高粱KNOX基因家族分为Class Ⅰ和Class Ⅱ两类;基因结构分析表明,Class Ⅱ类中各亚类家族成员之间的外显子和内含子数量存在较大差异;Motif分析显示,Homeobox KN结构域最为保守。qRT-PCR分析表明,SbKNOX22在高粱叶片中表达,水杨酸处理6 h时表达量最高,PEG 6000和甘露醇模拟干旱胁迫处理0.5 h后表达量开始降低,NaCl胁迫处理9 h时表达量最高。本研究结果为进一步探索KNOX家族在调节高粱生长发育、信号转导和植物激素调控等过程中的作用提供了基础。
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| 关 键 词： | 高粱 KNOX基因家族 表达分析 胁迫 |
| 收稿时间： | 2019-11-11 |
Identification of KNOX Gene Family and Expression Analysis of SbKNOX22 in Sorghum |
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| CHEN Jun,FANG Yuanpeng,JIANG Junmei,YANG Zaifu,REN Mingjian,LI Xiangyang,JIANG Xuanli,XIE Xin. Identification of KNOX Gene Family and Expression Analysis of SbKNOX22 in Sorghum[J]. Acta Agriculturae Nucleatae Sinica, 2020, 34(11): 2377-2385. DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2020.11.2377 |
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| Authors: | CHEN Jun FANG Yuanpeng JIANG Junmei YANG Zaifu REN Mingjian LI Xiangyang JIANG Xuanli XIE Xin |
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| Affiliation: | 1College of Agricultural, Guizhou University, Guiyang, Guizhou 550025; 2Guizhou Sub-Center of National Wheat Improvement Center, Guiyang, Guizhou 550025; 3Key Laboratory of Green Pesticide and Agricultural Bioengineering, Ministry of Education, Guizhou University, Guiyang, Guizhou 550025 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sorghum KNOX gene family expression analysis stress |
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