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梭梭EF hand CaBP基因克隆及序列分析
引用本文:周晓燕,甘晓燕,石 磊,陈虞超,李 苗,宋玉霞. 梭梭EF hand CaBP基因克隆及序列分析[J]. 西北农业学报, 2012, 21(6): 47-52
作者姓名:周晓燕  甘晓燕  石 磊  陈虞超  李 苗  宋玉霞
作者单位:1. 宁夏农业生物技术重点实验室,银川 750002;宁夏大学生命科学学院,银川 750021
2. 宁夏农业生物技术重点实验室,银川,750002
基金项目:宁夏回族自治区科技攻关宁陕合作项目资助
摘    要:采用RT-PCR、RACE等方法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出EF-handCaBP(EF-hand calcium-binding protein)基因的cDNA序列(GenBank登录号为JQ023165),其开放阅读框为732bp,推测的氨基酸序列全长为243个氨基酸残基。运用SMART、GOR4、TMPred等生物信息学软件对梭梭EF-hand CaBP功能域、跨膜结构进行分析显示,梭梭EF-hand CaBP含有26个氨基酸的信号肽序列及4个保守的钙结合位点(EF-hand),并且存在2种跨膜模型,推测梭梭EF-hand CaBP基因可能定位于液泡膜或叶绿体膜上。

关 键 词:梭梭  钙结合蛋白  EF-hand手型  序列分析

Cloning and Sequence Analysis EF hand CaBP Gene from Haloxylon ammodendron
ZHOU Xiaoyan,GAN Xiaoyan,SHI Lei,CHEN Yuchao,LI Miao and SONG Yuxia. Cloning and Sequence Analysis EF hand CaBP Gene from Haloxylon ammodendron[J]. Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica, 2012, 21(6): 47-52
Authors:ZHOU Xiaoyan  GAN Xiaoyan  SHI Lei  CHEN Yuchao  LI Miao  SONG Yuxia
Affiliation:1(1.Ningxia Academy of Agriculture and Forestry Sciences,Yinchuan 750002,China; 2.College of Life Science,Ningxia University,Yinchuan 750021,China)
Abstract:
Keywords:Halxylon  Calcium-binding protein  EF-hand  Sequence analysis
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