香蕉抗病种质RLK—RGAs的克隆与序列差异分析 |
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作者姓名: | 徐金刚 向旭 蔡礼鸿 黄秉智 孟祥春 |
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作者单位: | 1. 广东省农业科学院果树研究所,广州五山,510640;华中农业大学园艺林学学院,湖北武汉,430070 2. 广东省农业科学院果树研究所,广州五山,510640 3. 华中农业大学园艺林学学院,湖北武汉,430070 |
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摘 要: | 利用其他植物抗病基因PK类保守域的9个结构域所设计简并引物,从抗镰刀菌枯萎病香蕉种质ROSE和GCTCV-119中分离了20个香蕉RGA片段,大小为530bp左右,其中14条DNA片段和6条cDNA片段.根据其推断的氨基酸序列,经过保守结构域分析,其结构域为S_TKc,为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶家族成员,包含4功能域,分别为ATP binding pocket,substrate binding pocket,catalytic loop和activation loop.具有9个高度保守的氨基酸区域:Ⅰ.FG(K/V/L/S)VY(K/R)G;Ⅱ.VAVK;Ⅲ.FxxE;Ⅳ.(L/V/I)Vx(I/V/L);Ⅴ.ALV;Ⅵ.D(L/I/V)K;Ⅶ.DFG;Ⅷ.G(T/S)xGY(L/I/A)PE;Ⅸ.D(Y/I)YS-(F/Y)G(V/I/M).将这20条RGAs序列分别命名为Mu-PK1,Mu-PK2,……,Mu-PK20,并提交GenBank,获得登录号分别为EU293391-EU293404(DNA片段),EU338457-EU338462(cDNA片段).
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关 键 词: | 香蕉 抗病种质 类受体蛋白激酶 抗病基因同源序列 |
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