| 苋菜AmSPL基因家族转录组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 陈家兰,赵春丽,王晓,郑友峰,赖钟雄,刘生财. 苋菜AmSPL基因家族转录组鉴定及表达分析[J]. 中国农业大学学报, 2020, 25(12): 19-29 |
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| 作者姓名： | 陈家兰 赵春丽 王晓 郑友峰 赖钟雄 刘生财 |
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| 作者单位： | 福建农林大学 园艺植物生物工程研究所, 福州 350002 |
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| 基金项目： | 福建省自然科学基金(2018 J01700)；福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017174,CXZX2016118,CXZX2017189)；福建省高原学科建设经费(102/71201801101) |
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| 摘 要： | 为明确SPL(Squamosa Promoter Binding Protein Like)在苋菜中的功能，基于‘全红’苋菜转录组数据库筛选获得17个SPL家族成员，并进行生物信息学分析预测。结果表明，17 个AmSPL蛋白分别由186~777 个氨基酸组成，相对分子量从20.53~88.27 ku。构建AmSPL与拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)16个AtSPL成员系统进化树，并根据AtSPLs基因家族的分类标准将AmSPL成员分为6组。实时荧光定量PCR分析表明，在黑暗条件下，AmSPLs的表达量均高于蓝光下，推测AmSPLs的表达可能通过某种方式受到蓝光的负调控。预测分析其中的8 个AmSPL可能是miR156的靶基因。
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| 关 键 词： | 苋菜；转录组测序；AmSPL基因家族；生物信息学分析；表达 |
| 收稿时间： | 2020-01-20 |
Transcriptome-wide identification and expression analysis of AmSPL family members in Amaranthus tricolor L. |
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| CHEN Jialan,ZHAO Chunli,WANG Xiao,ZHENG Youfeng,LAI Zhongxiong,LIU Shengcai. Transcriptome-wide identification and expression analysis of AmSPL family members in Amaranthus tricolor L.[J]. Journal of China Agricultural University, 2020, 25(12): 19-29 |
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| Authors: | CHEN Jialan ZHAO Chunli WANG Xiao ZHENG Youfeng LAI Zhongxiong LIU Shengcai |
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| Affiliation: | Institute of Horticultural Biotechnology, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China |
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