| 基于黄地老虎转录组测序的SSR和SNP特征分析 |
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| 引用本文： | 常 虹,高 燕,王思威,王潇楠,刘艳萍,孙海滨.基于黄地老虎转录组测序的SSR和SNP特征分析[J].广东农业科学,2022,49(2):118-125. |
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| 作者姓名： | 常 虹 高 燕 王思威 王潇楠 刘艳萍 孙海滨 |
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| 作者单位： | 广东省农业科学院植物保护研究所/广东省植物保护新技术重点实验室,广东 广州 510640 |
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| 基金项目： | 广东省农业科学院青年导师制项目（R2020QD-021）；广东省农业科学院院长基金（202026）；广东省重点领域研发计划项目（2020B020223004） |
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| 摘 要： | 目的]基于黄地老虎转录组测序结果,对其SSR及SNP位点信息进行分析.方法]对黄地老虎总RNA进行提取,使用Illumina平台对转录组进行测序,利用MISA和GATK软件分别对黄地老虎转录组的SSR和SNP位点特征信息进行分析.结果]黄地老虎转录组数据库包含66469条Unigene序列.利用MISA对Unig...
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| 关 键 词： | 黄地老虎 转录组 微卫星 简单重复序列 单核苷酸多态性 |
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