| 草莓果实中七次跨膜受体蛋白生物信息学及时空表达特征分析 |
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| 引用本文： | 李兴亮,丁宁,范意娟,贾美茹,魏灵芝,姜金铸,李冰冰,贾文锁.草莓果实中七次跨膜受体蛋白生物信息学及时空表达特征分析[J].中国农业大学学报,2015,20(3):73-81. |
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| 作者姓名： | 李兴亮 丁宁 范意娟 贾美茹 魏灵芝 姜金铸 李冰冰 贾文锁 |
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| 作者单位： | 中国农业大学 农学与生物技术学院,北京,100193 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31171921) |
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| 摘 要： | 以草莓为试材,基于拟南芥(Arabidopsis thaliana)、人(Homo sapiens)和家鼠(Mus musculus)等数据库信息,采用同源比对方法,结合ClustalX 2.0序列比对及MEGA 5.0系统进化树分析,对草莓基因组中7TMR的基础生物信息进行了分析。结果表明,草莓基因组中含有84个7TMR,包括23个亚家族。半定量RT-PCR分析表明,该家族全部成员中有33个成员随果实发育表达量明显上调,17个成员表达量明显下调;Real-time PCR分析进一步确认,部分7TMR成员的基因表达与果实发育及成熟过程的整个进程有着密切的关系。此外还发现,草莓中7TMR家族中含有一类特殊的亚家族蛋白,该亚家族与人和家鼠中的脂联素受体高度同源,表明草莓中7TMR存在着非G-蛋白偶联信号转导途径。草莓中类似脂联素受体亚家族ADIPOR包含5个成员,对这5个成员的时空表达和刺激应答进行了分析,发现其中某些成员不仅与果实发育进程关系密切,且对糖信号应答,暗示着该类蛋白在草莓果实发育和成熟调控中可能起着重要作用。
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| 关 键 词： | 草莓 果实发育 7次跨膜受体蛋白 脂联素受体 |
| 收稿时间： | 2014/6/9 0:00:00 |
Bioinformatics and expressional analysis of 7 transmembrane receptor proteins in strawberry (Sweet Charlie) fruits |
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| LI Xing-liang,DING Ning,FAN Yi-juan,JIA Mei-ru,WEI Ling-zhi,JIANG Jin-zhu,LI Bing-bing and JIA Wen-suo.Bioinformatics and expressional analysis of 7 transmembrane receptor proteins in strawberry (Sweet Charlie) fruits[J].Journal of China Agricultural University,2015,20(3):73-81. |
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| Authors: | LI Xing-liang DING Ning FAN Yi-juan JIA Mei-ru WEI Ling-zhi JIANG Jin-zhu LI Bing-bing and JIA Wen-suo |
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| Institution: | College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | strawberry fruit development 7 transmembrane receptor protein adiponectin receptors |
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