桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族的鉴定及其在低温胁迫下的表达分析 |
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作者姓名: | 郝兰兰 马乃膺 张仲兴 李小兰 王鸿 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学园艺学院;2. 甘肃省农业科学院林果花卉研究所 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31760558);;国家现代农业产业技术体系(CARS30-1-6); |
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摘 要: | 【目的】从桃基因组鉴定Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并进行生物信息学与低温表达分析,为桃抗逆性研究提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法分析桃46个Q型C2H2锌指蛋白家族成员的理化性质、系统进化和基因结构等,并利用实时荧光定量分析其低温胁迫下的表达特征。【结果】桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员氨基酸数量介于155~607,且主要位于细胞核中。染色体定位揭示该家族成员不均匀地分布在8条染色体上。系统进化分析将桃和拟南芥的Q型C2H2基因聚为16个亚组。基因结构分析表明:同一亚族成员结构相似,外显子数量基本相同。顺式作用元件分析表明:大多数Q型C2H2锌指蛋白家族成员启动子序列上游2 000 bp区域包含大量激素及非生物胁迫响应元件。qRT-PCR分析表明:低温胁迫下,桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员中有16个成员为上调表达,且以PpC2H2-18基因最为显著。【结论】该家族成员均含有较高的保守基序和结构域,且可参与植物生长发育以及生物和非生物胁迫等,为桃的抗寒育种提供了参考。
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关 键 词: | 桃 Q型C2H2锌指蛋白 低温胁迫 表达分析 |
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