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利用鸡胚表达谱数据筛选皮肤发育相关基因的研究
摘    要:家鸡(Gallus domesticus)躯体被覆羽毛而跖部为鳞片状皮肤,代表了比较典型的皮肤结构,是研究皮肤调控机理的理想模型。本研究利用来航鸡胚胎期背部和跖部皮肤的表达谱数据(GSE62882),筛选不同日龄胚胎背部羽毛皮肤上皮(7 d、9 d)、间充质(7 d、9 d)和跖部鳞片皮肤上皮(9 d、11 d)、间充质(9 d、11d)的差异表达基因,探讨胚胎皮肤发育的调控通路。结果显示:羽毛皮肤上皮(7d、9d)鳞片皮肤上皮(9 d、11 d)差异表达显著基因(Padj0.05),分别为28个和116个;对4组极表达差异显著基因(P0.01)进行GO分析,发现富集在单细胞组织发育相关条目的差异基因最多,羽毛上皮(7 d、9 d)部分差异基因富集在细胞黏附;4组差异基因的KEGG分析中,筛选出共同的信号通路黏附斑激酶(FAK)信号通路,该通路介导的细胞黏附活动可能参与鸡胚胎皮肤发育过程。血小板源性生长因子(Platelet Derived Growth FactorSubunitB,PDFGB)、关键基因纤维连接蛋白1(Fibronectin1,FN1)和细胞基质蛋白(Periostin,POSTN)参与FAK信号通路,是值得关注的基因。

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