| 小兰屿蝴蝶兰R2R3-MYB转录因子分析 |
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| 引用本文： | 王雪霁,梁立雄,李潞滨,王涛. 小兰屿蝴蝶兰R2R3-MYB转录因子分析[J]. 林业科学研究, 2018, 31(3): 104-113 |
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| 作者姓名： | 王雪霁 梁立雄 李潞滨 王涛 |
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| 作者单位： | 林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所 |
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| 基金项目： | ‘十二五’农村领域国家科技支撑计划子课题（2012BAD01B0702） |
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| 摘 要： | [目的]本研究为了探讨在植物发育和抗逆过程扮演着重要角色的MYB转录因子的潜在功能。[方法]利用拟南芥MYB转录因子家族蛋白序列(At MYBs)和已报道的蝴蝶兰R2R3-MYB转录因子家族蛋白序列(Pe MYBs),采用本地化软件BLASTP对小兰屿蝴蝶兰全基因组数据库进行搜索,并利用Pfam数据库验证MYB结构域,获得小兰屿蝴蝶兰MYB转录因子家族编码序列(Pe MYBs)125条,包含1R-MYB结构域的Pe MYBs蛋白序列27条,R2R3-MYB结构域96条,R1R2R3-MYB结构域2条。重点对96条R2R3-MYB结构Pe MYBs蛋白序列特点进行生物信息学分析。[结果]依据拟南芥的分类标准将小兰屿蝴蝶兰R2R3-MYB类转录因子划分为20个亚群,预测获得同源性较高的直系和旁系同源基因;各基因在四种器官(花、叶、根、茎)中的表达情况各异,39个Pe MYBs基因在4种器官中均表达,48个基因在不同器官中有特异性不表达现象,一些基因呈现器官特异性表达特点,推测其可能参与相应组织特定发育时期的调控。[结论]预测获得125条Pe MYBs蛋白序列,并对部分Pe MYB转录因子可能的调控功能进行了预测,将为细致研究蝴蝶兰MYB转录因子调控植物生长发育和逆境胁迫响应的分子机理提供一定的数据基础。
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| 关 键 词： | 小兰屿蝴蝶兰 R2R3-MYB转录因子家族 全基因组分析 |
| 收稿时间： | 2016-12-29 |
Genome-wide Analysis of R2R3-MYB Transcription Factors in Phalaenopsis equestris |
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| WANG Xue-ji,LIANG Li-xiong,LI Lu-bin and WANG Tao. Genome-wide Analysis of R2R3-MYB Transcription Factors in Phalaenopsis equestris[J]. Forest Research, 2018, 31(3): 104-113 |
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| Authors: | WANG Xue-ji LIANG Li-xiong LI Lu-bin WANG Tao |
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| Affiliation: | State Key Laboratory of Tree Genetic and Breeding, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of State Forestry Administration, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China,State Key Laboratory of Tree Genetic and Breeding, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of State Forestry Administration, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China,State Key Laboratory of Tree Genetic and Breeding, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of State Forestry Administration, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China and State Key Laboratory of Tree Genetic and Breeding, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of State Forestry Administration, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Phalaenopsis equestris R2R3-MYB gene family genome-wide analysis |
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