| 麻竹笋转录组测序及苦涩味物质合成基因差异表达分析 |
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| 引用本文： | 李露双,董文慧,丁兴萃,章志远,孙春娃,蔡函江. 麻竹笋转录组测序及苦涩味物质合成基因差异表达分析[J]. 林业科学研究, 2018, 31(4): 38-46 |
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| 作者姓名： | 李露双 董文慧 丁兴萃 章志远 孙春娃 蔡函江 |
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| 作者单位： | 国家林业局竹子研究开发中心;浙江人文园林股份有限公司 |
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| 基金项目： | 科技部对发展中国家科技援助项目"中国向巴西提供竹子培育与高效利用技术"（KY201502001） |
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| 摘 要： | [目的]研究避光处理对麻竹笋苦涩味物质合成相关基因表达的影响。[方法]利用Illumina HiSeq~(TM)2500平台对自然生长(CK)和覆土处理(EP)2种类型的麻竹笋进行转录组测序,并对差异表达基因进行分析。[结果]转录组测序共获得36.45 Gb原始数据,经组装去冗余处理得到53 388个Unigene,将所得Unigene比对到Nr、Pfam、COG、Swissprot、GO和KEGG数据库中进行功能注释,发现共有31 462条Unigene与其它物种的基因具有同源性。对CK和EP处理所测得的Unigene进行表达量的比较分析,筛选出1 846个差异基因,其中,在EP处理中上调表达基因998个,下调表达基因848个。由KEGG代谢通路分析发现,差异基因显著地富集在32个代谢途径中,其中,包含与苦涩味物质合成相关的糖酵解途径、苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸合成途径等。进一步研究发现,参与麻竹笋芳香族氨基酸、单宁合成的PFK、ENO、PPY-AT/HPP-AT、LAR等酶基因在EP处理中表达量下降,荧光定量PCR验证结果与测序结果基本一致。[结论]避光处理抑制了苯丙氨酸、酪氨酸、单宁生物合成关键酶基因的表达,可能最终影响麻竹笋苦涩味物质的合成。
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| 关 键 词： | 麻竹笋 避光 转录组测序 苦涩味物质 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2018-01-02 |
Transcriptome Sequencing and Differential Expression Analysis of Bitter and Astringent Substances Biosynthesis Related Gene in Dendrocalamus latiflorus |
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| LI Lu-shuang,DONG Wen-hui,DING Xing-cui,ZHANG Zhi-yuan,SUN Chun-wa and CAI Han-jiang. Transcriptome Sequencing and Differential Expression Analysis of Bitter and Astringent Substances Biosynthesis Related Gene in Dendrocalamus latiflorus[J]. Forest Research, 2018, 31(4): 38-46 |
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| Authors: | LI Lu-shuang DONG Wen-hui DING Xing-cui ZHANG Zhi-yuan SUN Chun-wa CAI Han-jiang |
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| Affiliation: | China National Bamboo Research Center, Hangzhou 310012, Zhejiang, China,China National Bamboo Research Center, Hangzhou 310012, Zhejiang, China,China National Bamboo Research Center, Hangzhou 310012, Zhejiang, China,Zhejiang Humanities Landscape Co. Ltd, Hangzhou 310012, Zhejiang, China,China National Bamboo Research Center, Hangzhou 310012, Zhejiang, China and China National Bamboo Research Center, Hangzhou 310012, Zhejiang, China |
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