| 亚麻DMP基因家族的全基因组鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 李雯,赵丽蓉,张建平,刘自刚,齐燕妮,李闻娟,谢亚萍.亚麻DMP基因家族的全基因组鉴定与分析[J].草业学报,2023,32(3):91-106. |
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| 作者姓名： | 李雯 赵丽蓉 张建平 刘自刚 齐燕妮 李闻娟 谢亚萍 |
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| 作者单位： | 1.甘肃农业大学农学院，甘肃省干旱生境作物重点实验室，甘肃省作物遗传改良与种质资源创新重点实验室，甘肃 兰州 730070;2.甘肃省农业科学院作物研究所，甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 国家特色油料产业技术体系;甘肃省农业科学院现代生物育种项目(2020GAAS08);国家自然基金项目(31760426) |
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| 摘 要： | DMP家族成员是植物特有的膜蛋白，在植物生殖发育及衰老过程中发挥重要作用。亚麻是我国重要的油料及经济作物，目前关于DMP基因家族在亚麻中的分布及功能研究尚未有报道。本研究利用生物信息学方法对亚麻DMP基因家族进行鉴定，对其序列特征、系统进化、复制事件进行了分析，并利用转录组数据和qRT-PCR分析其在不同组织器官及胁迫处理下的表达模式。本研究以陇亚10号基因组为参照，利用同源性分析共鉴定到17个LuDMP成员，命名为LuDMP-1～LuDMP-17，不均匀分布在9条染色体上。序列特征分析结果表明，除LuDMP-9、LuDMP-16和LuDMP-17外，其余成员均不含内含子；基因启动子区含有大量激素与逆境胁迫相关响应元件；编码的蛋白氨基酸长度为195～240 aa，分子量为20946～25830 Da，等电点为4.76～9.71；所有蛋白均为疏水性蛋白，含有2～5个跨膜结构域及4～8个motif，其中有4个motif存在于所有LuDMP蛋白；绝大多数蛋白定位于细胞膜。LuDMP家族共有3对串联复制事件和8对片段复制事件，进化过程中经历了强烈的纯化选择。转录组分析结果表明，大多数LuDMP...
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| 关 键 词： | 亚麻 DMP基因家族 单倍体诱导 表达分析 |
| 收稿时间： | 2022-02-23 |
| 修稿时间： | 2022-04-06 |
Genome-wide identification and analysis of the DMP gene family in flax （Linum usitatissimum） |
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| Wen LI,Li-rong ZHAO,Jian-ping ZHANG,Zi-gang LIU,Yan-ni QI,Wen-juan LI,Ya-ping XIE.Genome-wide identification and analysis of the DMP gene family in flax （Linum usitatissimum）[J].Acta Prataculturae Sinica,2023,32(3):91-106. |
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| Authors: | Wen LI Li-rong ZHAO Jian-ping ZHANG Zi-gang LIU Yan-ni QI Wen-juan LI Ya-ping XIE |
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| Institution: | 1.College of Agriculture，Gansu Agricultural University，Key Laboratory of Arid Land Crop of Gansu Province，Key Laboratory of Crop Genetic Improvement and Germplasm Resources Innovation of Gansu Province，Lanzhou 730070，China;2.Institute of Crop Research，Gansu Academy of Agricultural Sciences，Lanzhou 730070，China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | flax DMP gene family haploid induction expression analysis |
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