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基于网络药理学和分子对接探究山楂调节氧化应激的作用机制
引用本文:张祖烽,张宇欣,孙悦龙,郑威,李秀梅.基于网络药理学和分子对接探究山楂调节氧化应激的作用机制[J].中国畜牧兽医,2023,50(1):408-420.
作者姓名:张祖烽  张宇欣  孙悦龙  郑威  李秀梅
作者单位:1. 哈尔滨商业大学药学院, 哈尔滨 150076;2. 中国农业科学院饲料研究所, 北京 100081
基金项目:哈尔滨商业大学"青年创新人才"支持计划(2019CX39)
摘    要:【目的】运用网络药理学和分子对接方法研究山楂调节氧化应激的活性成分及潜在作用机制。【方法】通过TCMSP数据库检索山楂的化学成分及其作用靶点;在Uniprot数据库中对所得靶点进行标准基因名转化。利用GeneCards和OMIM数据库筛选氧化应激相关靶点。通过Venny 2.1.0软件获得山楂和氧化应激的交集靶点;借助STRING数据库和Cytoscape 3.8.0软件构建山楂-主要活性成分-靶点网络和蛋白-蛋白互作网络,筛选核心靶点,随后利用AutoDockTools 1.5.7和AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接。应用DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路注释分析,结果由Pymol软件进行可视化作图。【结果】筛选获得槲皮素、山奈酚、异鼠李素、豆甾醇、谷甾醇、表儿茶素等山楂的主要活性成分。基于主要活性成分和氧化应激分别筛选获得185和9 647个靶点,其中山楂与氧化应激交集靶点共171个,如丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶AKT(serine/threonine-protein kinase AKT,AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(cellular tumor a...

关 键 词:山楂  网络药理学  分子对接  氧化应激  作用机制
收稿时间:2022-08-09

Study on Mechanism of Hawthorn in Regulating Oxidative Stress Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
ZHANG Zufeng,ZHANG Yuxin,SUN Yuelong,ZHENG Wei,LI Xiumei.Study on Mechanism of Hawthorn in Regulating Oxidative Stress Based on Network Pharmacology and Molecular Docking[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2023,50(1):408-420.
Authors:ZHANG Zufeng  ZHANG Yuxin  SUN Yuelong  ZHENG Wei  LI Xiumei
Institution:1. School of Pharmacy, Harbin University of Commerce, Harbin 150076, China;2. Institute of Feed Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China
Abstract:
Keywords:hawthorn  network pharmacology  molecular docking  oxidative stress  mechanism  
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