唐古特扁桃叶绿体基因组特征分析

采用Illumina HiSeq X Ten平台测序和生物信息法对唐古特扁桃叶绿体基因组序列特征进行解析。结果表明：唐古特扁桃叶绿体基因组为四分体式结构，完整叶绿体基因组序列全长158 166 bp，G+C含量 36.8%，注释131个基因，即86个蛋白编码基因、8个rRNA基因和37个tRNA基因；其叶绿体基因组共有52 711个编码密码子，有33种类型是偏好密码子；唐古特扁桃叶绿体基因组中SSR位点有33个，串联重复有 13个；SSR中未检测到三核苷酸重复；SSR分布不平衡，大多位于基因间区IGS和LSC区域；基于叶绿体全基因组序列构建系统发育建树，发现唐古特扁桃与同亚属的榆叶梅、野樱桃以及李属毛樱桃亲缘关系较近。