鸡U6核内小RNA基因的克隆与分析 |
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引用本文: | 孙婴宁,王维世,高媛,李辉,王宁.鸡U6核内小RNA基因的克隆与分析[J].中国畜牧杂志,2013,49(5). |
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作者姓名: | 孙婴宁 王维世 高媛 李辉 王宁 |
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作者单位: | 1. 东北农业大学动物科学技术学院,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江哈尔滨 150030;齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,黑龙江齐齐哈尔 161006 2. 东北农业大学动物科学技术学院,黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室,农业部鸡遗传育种重点实验室,黑龙江哈尔滨 150030 |
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基金项目: | 国家973计划课题,黑龙江省高等学校科技创新团队建设项目资助项目,现代农业产业技术体系建设专项资金 |
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摘 要: | 本研究旨在获得鸡U6 snRNA的全序列,并对其序列、启动子及拷贝数等进行分析。本实验通过RT-PCR、克隆、测序获得了鸡U6 snRNA的部分序列(94 bp)。根据测序结果和鸡全基因组序列数据,结合生物信息学分析,结果获得了鸡U6 snRNA的全长序列(106 bp),该序列与人U6 snRNA序列相似性为100%,在鸡基因组中有4个拷贝,其中3个成簇存在于28号染色体上一段2 kb长的DNA片段上;另一个位于18号染色体。已有研究报道,这4个基因拷贝的5′侧翼区均具有启动子活性,说明它们是真基因。结果表明:这4个U6 snRNA基因启动子区均含有潜在的远端序列元件(DSE)、近端序列元件(PSE)和TATA box等RNA聚合酶Ш启动子元件。本研究成功获得了鸡U6 snRNA的全长序列,为选用U6基因作为内参基因开展鸡miRNA定量表达分析以及鸡U6基因的转录调控研究奠定基础。
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关 键 词: | 核内小RNA 克隆 启动子 鸡 |
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