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二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
引用本文:徐红星 王国荣 鲁艳辉,杨亚军 郑许松 田俊策 吕仲贤. 二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价[J]. 中国水稻科学, 2019, 33(1): 75-84. DOI: 10.16819/j.1001-7216.2019.8035
作者姓名:徐红星 王国荣 鲁艳辉  杨亚军 郑许松 田俊策 吕仲贤
作者单位:1.浙江省农业科学院 农业部农产品信息溯源重点实验室/省部共建国家重点实验室培育基地, 杭州 310021;2.杭州市萧山区农业技术推广中心, 杭州 311202
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31672050);浙江省植物有害生物防控省部共建国家重点实验室培育基地自主设计项目(2010DS700124- ZZ1601)。
摘    要:【目的】筛选特定试验条件下二化螟(Chilosuppressalis)稳定表达的内参基因,为二化螟基因表达研究奠定基础。【方法】根据二化螟转录组测序结果挑选出11个候选基因,利用实时荧光定量PCR测定其在二化螟不同发育历期、不同组织、温度处理、杀虫剂处理、取食不同饲料、取食不同水稻、dsRNA处理和混合样品的表达量,利用RefFinder、BestKeeper、Ge Norm和NormFinder等软件和ΔC_t值对11个候选基因的稳定性进行评估。【结果】5种分析方法表明,在二化螟不同发育历期稳定性较高的内参基因是AK、RPL10和EF1,不同组织中稳定性较高的内参基因是EF1、TUB和ACTB,不同温度下较稳定的内参基因为TUB、RPL10和EF1,杀虫剂处理样品中较稳定的是TF4和ACTA,取食不同饲料较稳定的是TUB、TF4、EF1和RPL10,取食不同品种水稻较稳定的是TUB和EF1,dsRNA处理样品中较稳定的是TUB、AK、ACTB和EF1,混合样品中较稳定的是EF1、TUB和ACTB。【结论】为不同试验条件下选择合适的内参基因提供了参考,也有利于在二化螟基因表达研究中获得更加可靠准确的数据。

关 键 词:二化螟  内参基因  荧光定量PCR  基因表达
收稿时间:2018-03-27
修稿时间:2018-05-15

Screening Reference Genes and Evaluating of Their Expression Stability for qRT-PCR Normalization in Chilo suppressalis (Lepidoptera: Pyralididae)
XU Hongxing,WANG Guorong,LU Yanhui,YANG Yajun,ZHENG Xusong,TIAN Junce,Lü Zhongxian. Screening Reference Genes and Evaluating of Their Expression Stability for qRT-PCR Normalization in Chilo suppressalis (Lepidoptera: Pyralididae)[J]. Chinese Journal of Rice Science, 2019, 33(1): 75-84. DOI: 10.16819/j.1001-7216.2019.8035
Authors:XU Hongxing  WANG Guorong  LU Yanhui  YANG Yajun  ZHENG Xusong  TIAN Junce  Lü Zhongxian
Affiliation:1.Key Laboratory of Information Traceability for Agricultural Products, Ministry of Agriculture, P. R. of China/Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China;2.Xiaoshan Agricultural Technology Extension Center, Hangzhou 311202, China
Abstract:
Keywords:Chilo suppressalis  reference gene  qRT-PCR  gene expression
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