| 4种植物病害植原体病原质粒全序列测定及分子特征 |
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| 引用本文： | 胡佳续,宋传生,林彩丽,耿显胜,田国忠.4种植物病害植原体病原质粒全序列测定及分子特征[J].林业科学,2013,49(4). |
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| 作者姓名： | 胡佳续 宋传生 林彩丽 耿显胜 田国忠 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所 国家林业局森林保护学重点实验室 北京 100091 |
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| 摘 要： | 根据已发表植原体质粒序列设计引物,经2次PCR扩增,获得大小不同的2段DNA片段,测序后拼接得到4种完整的环状质粒,分别是桑树萎缩植原体濮阳株系质粒(pMDPy)、长春花绿变植原体海南株系质粒(pPeVHn)、泡桐丛枝植原体山东株系质粒(pPaWBG33D)及苦楝丛枝植原体福清株系质粒(pCWBFq-2),其中pMDPy为首次测定,其质粒全长分别为3 833,3 943,3 843和3 913 bp,4种质粒皆编码5种蛋白,ORF1和ORF5分别编码复制相关蛋白(RepA)和单链DNA结合蛋白(SSB),ORF2-4编码未知功能蛋白.4种质粒序列的非编码区分析表明,ORF1和ORF2之间的非编码区存在启动子和核糖体结合位点.将4种植原体质粒全序列与GenBank中登录的植原体质粒进行序列相似性比对和系统进化分析,结果表明这4种质粒与其他16Sr Ⅰ组的质粒聚为一个大的分支,与16S rDNA系统发育树基本一致.这可为进一步深入了解不同植原体质粒的结构与功能、寄主专化性和质粒基因变异及进化奠定基础,也可为基于多基因分类鉴定提供新的理论依据.
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| 关 键 词： | 植原体 质粒 序列分析 系统进化分析 |
Sequencing the Full-Length DNA and the Molecular Characterization of Four Plasmids from Plant Pathogens of Phytoplasma Disease |
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| Hu Jiaxu
,
Song Chuansheng
,
Lin Caili
,
Geng Xiansheng
,
Tian Guozhong.Sequencing the Full-Length DNA and the Molecular Characterization of Four Plasmids from Plant Pathogens of Phytoplasma Disease[J].Scientia Silvae Sinicae,2013,49(4). |
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| Authors: | Hu Jiaxu Song Chuansheng Lin Caili Geng Xiansheng Tian Guozhong |
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