| 苏钟猪FTO基因的mRNA表达、克隆测序及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 付言峰,李兰,王学敏,李碧侠,方晓敏,赵芳,任守文. 苏钟猪FTO基因的mRNA表达、克隆测序及其生物信息学分析[J]. 华北农学报, 2013, 0(1): 128-134 |
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| 作者姓名： | 付言峰 李兰 王学敏 李碧侠 方晓敏 赵芳 任守文 |
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| 作者单位： | 江苏省农业科学院畜牧研究所;中国农业大学动物医学院;国家兽用生物制品工程技术研究中心 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31201767);江苏省博士后科研资助计划经费;江苏省农业科学院博士后基金(No.026056511104);国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站(nycytx-009) |
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| 摘 要： | 脂肪肥胖相关基因(FTO)在控制食欲和能量消耗方面具有重要作用。为进一步了解猪FTO基因的结构和功能,以苏钟猪为试验对象,利用RT-PCR方法,分析该基因在苏钟猪5种不同组织(肺脏、肝脏、心脏、背膘和背最长肌)RNA水平的表达谱信息;对苏钟猪FTO基因的编码序列(CDS)进行了克隆测序,并用生物信息学方法分析了苏钟猪FTO蛋白的结构和不同物种间的同源性。结果表明,FTO基因在苏钟猪各组织中的mRNA表达丰度表现为:背膘>心脏>肺脏>肝脏>背最长肌,其中背膘中的表达量显著高于其他组织(P<0.05)。苏钟猪FTO的CDS区发现了8个SNPs,分别为G52A、C523T、G628A、A655G、A810G、A886G、G1002A和A1344G。苏钟猪FTO基因编码一个含505个氨基酸的蛋白,理论等电点为5.23,具有亲水性,不存在信号肽,是非分泌型蛋白,与牛、绵羊、狗等物种的亲缘关系最近。FTO的mRNA表达对苏钟猪的皮下脂肪、心脏、肌肉等组织的脂肪沉积有一定影响,其编码序列中丰富的SNPs可成为苏钟猪肉质改良育种中的重要分子标记。
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| 关 键 词： | 苏钟猪 脂肪肥胖相关基因 克隆测序 遗传变异 生物信息学 |
The mRNA Expression,Cloning and Sequencing of FTO gene and Bioinformatics Analysis in Suzhong Pig |
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| FU Yan-feng,LI Lan,WANG Xue-min,LI Bi-xia,FANG Xiao-min,ZHAO Fang,REN Shou-wen. The mRNA Expression,Cloning and Sequencing of FTO gene and Bioinformatics Analysis in Suzhong Pig[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2013, 0(1): 128-134 |
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| Authors: | FU Yan-feng LI Lan WANG Xue-min LI Bi-xia FANG Xiao-min ZHAO Fang REN Shou-wen |
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| Affiliation: | 1(1.Institute of Animal Science,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Nanjing 210014,China; 2.College of Veterinary Medicine,China Agricultural University,Beijing 100193,China;3.National Research Center of Veterinary Biologicals Engineering and Technology,Nanjing 210014,China) |
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