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白菜型冬油菜NCED3基因、启动子的克隆及其表达分析
引用本文:武军艳,马骊,方彦,张亚宏,马学才,刘丽君,牛早霞,李学才,李爱国,孙万仓.白菜型冬油菜NCED3基因、启动子的克隆及其表达分析[J].干旱地区农业研究,2020,38(5):64-70.
作者姓名:武军艳  马骊  方彦  张亚宏  马学才  刘丽君  牛早霞  李学才  李爱国  孙万仓
作者单位:College of Agronomy, Gansu Agricultural University, Rapeseed Engineering Research Center of Gansu Province, Lanzhou, Gansu 730070, China;Tianshui Institute of Agricultural Sciences, Tianshui, Gansu 741001, China;Institute of Dry Farming, Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Hengshui, Hebei 053500, China
基金项目:甘肃省自然科学基金(17JR5RA149);国家现代农业产业技术体系(CARS-12);甘肃省重大专项( 17ZD2NA016-4);甘肃省现代农业产业技术体系( GARS-TSZ-1)
摘    要:从2个不同抗寒性的冬油菜品种中克隆了NCED3基因及其启动子序列,并分析其在叶片和根中的表达,研究NCED3基因在冬油菜中的作用机理。结果表明,陇油6号的NCED3基因开放阅读框(ORF)长度为1 794 bp,编码597个氨基酸,分子量65.74 kD,理论等电点为5.81;天油2号的ORF与其长度相同,分子量为65.78 kD,理论等电点为5.94。2个蛋白都是亲水蛋白,具有疏水峰。根据预测,启动子具有生物过程中常见的顺式作用元件如CAAT-box等、分生组织表达CAT-box相关的顺式作用元件、-30 TATA box附近的核心启动子元件等,还有ABRE、TGA-element、CGTCA-motif、TGACG-element等激素响应元件,此外,还鉴定出低温响应元件(LTR)。2个品种启动子序列的相似度为99.38%,只有1个不同的顺式作用元件,即circadian,推测其与昼夜节律相关。低温、PEG及ABA处理后NCED3在叶片和根中的表达均高于对照,增加范围为0.07~6.48,且均于8 h达到峰值。与根系的表达特性相比,胁迫处理后叶片的基因表达均在2 h显著升高,天油2号的升高幅度(1.54~6.00)均大于陇油6号(0.04~1.95)。

关 键 词:NCED3基因  白菜型冬油菜  抗寒性  启动子克隆  序列分析  胁迫  基因相对表达量

Gene and promoter cloning and gene expression analysis of NCED3 from winter rapeseed (Brassica rapa L.)
WU Junyan,MA Li,FANG Yan,ZHANG Yahong,MA Xuecai,LIU Lijun,NIU Zaoxi,LI Xuecai,LI Aiguo,SUN Wancang.Gene and promoter cloning and gene expression analysis of NCED3 from winter rapeseed (Brassica rapa L.)[J].Agricultural Research in the Arid Areas,2020,38(5):64-70.
Authors:WU Junyan  MA Li  FANG Yan  ZHANG Yahong  MA Xuecai  LIU Lijun  NIU Zaoxi  LI Xuecai  LI Aiguo  SUN Wancang
Abstract:
Keywords:NCED3 gene  winter rapeseed  cold resistance  promoter cloning  sequence analysis  stress  relative expression
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