茎瘤芥BXL基因家族的全基因组鉴定及在瘤状茎膨大过程中的表达分析 |
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引用本文: | 赖彪,陈春帆,刘春渝,朱纯真,杜丽娜. 茎瘤芥BXL基因家族的全基因组鉴定及在瘤状茎膨大过程中的表达分析[J]. 华中农业大学学报, 2020, 39(6): 155-163 |
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作者姓名: | 赖彪 陈春帆 刘春渝 朱纯真 杜丽娜 |
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作者单位: | 长江师范学院现代农业与生物工程学院,重庆 408100;长江师范学院现代农业与生物工程学院,重庆 408100;长江师范学院现代农业与生物工程学院,重庆 408100;长江师范学院现代农业与生物工程学院,重庆 408100;长江师范学院现代农业与生物工程学院,重庆 408100 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31701928); 重庆市科技局基础科学与前沿技术研究专项(cstc2017jcyjAX0226); 重庆市教委科学技术研究项目(KJ1712305); 长江师范学院校级科研项目(2016KYQD19和2016XJQN07) |
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摘 要: | 为深入解析BXL家族基因在茎瘤芥发育中的功能,利用生物信息学方法从茎瘤芥全基因组鉴定出16个BjuBXL,并系统分析了BjuBXL家族蛋白的理化性质、基因结构、保守基序、染色体定位和在茎膨大过程中的表达。结果表明:16个BjuBXL基因分为7类,共2个亚族,其中BjuBXL1-1~ BjuBXL1-4与拟南芥中参与细胞壁代谢和植物发育的AtBXL1亲缘关系相近;7个BjuBXL定位于A亚基因组的5条染色体上,8个定位于B亚基因组的4条染色体上;荧光定量PCR分析表明BjuBXL1-1和BjuBXL1-2在茎膨大过程中均明显上调,而且在茎的内髓区(P2~P4)表达量均显著高于外髓区(P1),可能参与茎膨大过程中茎内髓区的细胞壁代谢。
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关 键 词: | 茎用芥菜 茎瘤芥(Brassica juncea var.tumida) BXL 转录组 茎膨大 品质改良 |
收稿时间: | 2020-05-28 |
Genome-wide identification of BXL family genes in Brassica juncea var.tumida and their expression during swelling of stem |
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