| 新疆部分地区环形泰勒虫Tams1基因型及遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 葛晓敏,温丽翠,缪荣浩,李才善,刘凯强,陈宋琴,郑会珍,巴音查汗,郭庆勇.新疆部分地区环形泰勒虫Tams1基因型及遗传多样性分析[J].中国农业大学学报,2023,28(7):130-141. |
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| 作者姓名： | 葛晓敏 温丽翠 缪荣浩 李才善 刘凯强 陈宋琴 郑会珍 巴音查汗 郭庆勇 |
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| 作者单位： | 新疆农业大学 动物医学学院, 乌鲁木齐 830052 |
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| 基金项目： | 新疆自治区高校科研计划自然科学项目(XJEDU20201008)；新疆自治区区域协同创新专项-上海合作组织科技伙伴计划及国际科技合作计划项目(2021E01001) |
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| 摘 要： | 为了对新疆部分地区环形泰勒虫Tams1基因型及遗传多样性进行分析，本研究对新疆托克逊、艾丁湖、青河和伊吾地区奶牛血液DNA进行检测，采用PCR方法对Tams1基因扩增、克隆和测序，并进行序列比对。通过MEGA、DNAsp、NetNGlyc等软件及在线软件分析Tams1基因及其蛋白序列。结果显示：1)新疆地区23条环形泰勒虫序列除伊吾地区2号样品序列被归为G3型，其余均属于G1型；此外，新疆地区Tams1基因序列在核苷酸与氨基酸水平上分别具有90.1%～100%和83.9%～100%的相似性。2)Tams1序列在核苷酸的168～217和479～528位置之间可检测到广泛序列变异。通过Hd=0.994±0.006、π=0.071±0.002、S=178、h=38及k=52.32均显示Tams1序列较高的遗传多样性；中性指数结果显示当地环形泰勒虫Tams1基因单倍型数大于多态位点个数，遗传多样性呈平衡选择。3)Tams1蛋白的N末端显示出较大的序列变异性，在3个区域(氨基酸位置27～52、138～175和180～196)存在广泛变异。经B细胞抗原表位预测及3D结构同源建模，发现Tams1蛋白...
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| 关 键 词： | 环形泰勒虫 Tams1 基因分型 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2022/8/13 0:00:00 |
Genotype and genetic diversity analysis of Theileria annulata in selected areas of Xinjiang based on Tams1 gene |
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| GE Xiaomin,WEN Licui,MIAO Ronghao,LI Caishan,LIU Kaiqiang,CHEN Songqin,ZHENG Huizhen,BAYIN Chahan,GUO Qingyong.Genotype and genetic diversity analysis of Theileria annulata in selected areas of Xinjiang based on Tams1 gene[J].Journal of China Agricultural University,2023,28(7):130-141. |
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| Authors: | GE Xiaomin WEN Licui MIAO Ronghao LI Caishan LIU Kaiqiang CHEN Songqin ZHENG Huizhen BAYIN Chahan GUO Qingyong |
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| Institution: | College of Veterinary Medicine, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830052, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Theileria annulata Tams1 genotype genetic diversity |
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