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拟南芥miRNA及其靶序列配对特征分析
引用本文:刘冲,孙杰,范云六,王磊.拟南芥miRNA及其靶序列配对特征分析[J].中国农业科技导报,2009,11(4):53-57.
作者姓名:刘冲  孙杰  范云六  王磊
作者单位:1.石河子大学农学院, 绿洲生态实验室, 新疆 832003;2.中国农业科学院生物技术研究所,国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程, 北京 100081
基金项目:国家863计划项目,绿洲生态农业重点实验室开放课题发展基金 
摘    要:microRNAs(miRNAs)是真核生物中一类长度约为22 nt的非编码小分子RNA,miRNA与AGO等蛋白形成RISC沉默复合体,通过剪切或翻译抑制对靶基因起负调控作用。对拟南芥miRNA序列及其配对的靶序列间的特征进行了统计分析,结果表明miRNA序列5′端富含A、U,第1、第19碱基位对U、C具有较强的倾向性;miRNA与靶序列间常有1~4个碱基错配,错配碱基常出现在第1,第2和第21位,而第3~第6,第9~第10,第16~第17碱基配对较为保守,为人工合成miRNA的设计及miRNA靶基因的预测以提供了依据。

关 键 词:拟南芥  基因沉默  RNAi  微小RNA  人工小RNA  
收稿时间:2009-03-31
修稿时间:2009-06-22

Characterization of Arabidopsis microRNAs |and Matching to its Targets
LIU Chong,SUN Jie,FAN Yun-liu,WANG Lei.Characterization of Arabidopsis microRNAs |and Matching to its Targets[J].Journal of Agricultural Science and Technology,2009,11(4):53-57.
Authors:LIU Chong  SUN Jie  FAN Yun-liu  WANG Lei
Institution:1.College of Agriculture, Key Laboratory of Oasis Ecology Agriculture, Shihezi University, Xinjiang Shihezi 832003;2.Biotechnology Research Institute, |National Key Facility of Crop Gene Resources and Genetic Improvement, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China
Abstract:
Keywords:RNAi
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