3种芸薹属植物ROH1基因的克隆及分析 |
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引用本文: | 张贺翠,廉小平,柳菁,李帮秀,周燕. 3种芸薹属植物ROH1基因的克隆及分析[J]. 安徽农业科学, 2015, 0(3): 18-21,46. DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2015.03.007 |
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作者姓名: | 张贺翠 廉小平 柳菁 李帮秀 周燕 |
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作者单位: | 西南大学农学与生物科技学院,重庆,400716 |
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基金项目: | 中央高校基本业务费专项经费(XDJK2013C121) |
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摘 要: | [目的]通过PCR和RT-PCR技术从甘蓝、白菜和萝卜中扩增ROH1基因序列,分析该基因的基本特性。[方法]采用生物信息学的相关方法进行分析。[结果]甘蓝、白菜、萝卜ROH1基因没有内含子,甘蓝ROH1基因编码398个氨基酸,白菜和萝卜ROH1基因均编码400个氨基酸,3种植物的ROH1蛋白序列与拟南芥已经公布的ROH1(At1g63930)蛋白氨基酸缺少一段连续的氨基酸序列;ROH1属于DUF793蛋白超家族,它没有跨膜结构域和信号肽,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成。同源比对及功能联想分析发现植物中ROH1非常保守,系统发育分析表明甘蓝、白菜和萝卜的关系最近;结构功能分析发现ROH1可能与BYPASS蛋白和AT4G11300蛋白的功能相似。[结论]为研究DUF793蛋白超家族功能提供参考。
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关 键 词: | ROH1基因 基因克隆 DUF793蛋白超家族 |
Cloning and Analysis of ROH1 from Three Brassica Plants |
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Affiliation: | ZHANG He-cui;LIAN Xiao-ping;LIU Jing;College of Agronomy and Biotechnology ,Southwest University; |
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Abstract: | |
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Keywords: | ROH1 gene Gene clone DUF793 protein super family |
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