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甜瓜SWEET基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
引用本文:寿伟松,何艳军,沈佳,许昕阳.甜瓜SWEET基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析[J].浙江农业学报,2023(7):1591-1603.
作者姓名:寿伟松  何艳军  沈佳  许昕阳
作者单位:浙江省农业科学院蔬菜研究所
摘    要:糖外排转运子(sugars will eventually be exported transporter, SWEET)是一类新型的糖转运蛋白,其在植物生长发育、植物与病原体互作以及植物胁迫耐受性方面都起着重要作用。基于甜瓜中还未有该家族基因的相关报道,本研究开展CmSWEET的全基因组鉴定和生物信息学分析。通过同源性搜索,总共鉴定到17个甜瓜CmSWEET基因。这些基因分布于甜瓜8条染色体上,具有典型的MtN3/saliva结构域。系统发育树将拟南芥、黄瓜和甜瓜的SWEET蛋白分为4个进化分支,其中亚族Ⅲ是甜瓜和黄瓜独有的亚族。基因启动子区域的顺式作用元件显示,CmSWEET含有许多与植物激素和应激相关的调节元件,暗示了CmSWEET在参与调节甜瓜生长发育以及环境适应性方面有重要作用。基因表达量分析表明,大部分CmSWEET基因在花(雌花和雄花)和根中高表达,部分CmSWEET基因在果实发育时期表达量较高。此外,RNA-Seq结果暗示,CmSWEET基因可能参与对尖孢镰刀菌和白粉病菌侵染的抗性响应。本研究为今后探究CmSWEET蛋白在甜瓜生长发育过程以及响应生物和非生物胁迫中的分子...

关 键 词:甜瓜  糖外排转运子  全基因组鉴定  进化分析  表达分析
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