| 摘 要： | 为了探究孵化方式是否会影响仔鸡盲肠菌群的多样性,本研究将种蛋随机分为两组,分别采用孵化机孵化(J组)和母鸡孵化(M组)两种方式进行孵化。采集出壳前1 d、出壳后7 d和14 d的仔鸡盲肠内容物,基于高通量测序分析菌群多样性的差异。结果显示:出壳前1 d的仔鸡盲肠内均未检出菌群。出壳后7 d和14 d的仔鸡盲肠在门水平上,两个日龄的所有样本具有5个门的菌群,其中优势菌门均为厚壁菌门;而J组厚壁门的丰度均显著高于M组,M1组Campilobacterota门显著高于J1组,M2组变形门显著高于J2组。在纲水平上,所有样本具有9个纲的菌群,优势菌纲为梭菌纲;J1组的梭菌纲极显著高于M1组,而弯曲菌纲极显著低于M1组,M2组有3个菌纲显著高于J2组。在目水平上,共检测到12个菌目,J组的乳杆菌目均显著高于M组。在科水平上,共检测到18个菌科,均检测到丰度较高的毛螺旋菌科、瘤胃菌科,且M组的螺杆菌科、乳杆菌科、肠杆菌科的丰度显著高于J组。在属水平上,J组Ruminococcus_torques_group是优势菌属,M组的粪杆菌属是优势菌属。在种水平上,J组的优势菌种是uncultured_bacterium_g__Ruminococcus_torques_group,M组的优势菌种是uncultured_bacterium_g__Faecalibacterium,且在M组中检测出幽门螺杆菌和志贺氏菌。可见,不同孵化方式会影响仔鸡肠道菌群的多样性,母鸡孵化的仔鸡肠道菌群丰富度和多样性高于孵化机孵化。
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